基因页:PSG2
概括?
基因 | 5670 |
象征 | PSG2 |
同义词 | CEA | PSBG2 | PSG1 |
描述 | 怀孕特异性β-1-糖蛋白2 |
参考 | MIM:176391|HGNC:HGNC:9519|ENSEMBL:ENSG00000242221|HPRD:08891|Vega:Otthumg00000151547 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19Q13.1-Q13.2 |
Pascal P值 | 0.791 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PSG2 | CHR19 | 43579615 | C | 一个 | NM_031246 | p.200r> s | 错过 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2682594 | CHR19 | 43940775 | PSG2 | 5670 | 0.19 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PSG2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CHMP2A | 0.82 | 0.82 |
COPS6 | 0.82 | 0.83 |
LSM4 | 0.80 | 0.83 |
hras | 0.80 | 0.80 |
PSMD4 | 0.80 | 0.81 |
park7 | 0.80 | 0.80 |
AIP | 0.79 | 0.82 |
RNF7 | 0.78 | 0.78 |
PHB | 0.78 | 0.81 |
SSU72 | 0.77 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.52 | -0.41 |
MT-ATP8 | -0.52 | -0.45 |
AF347015.8 | -0.51 | -0.41 |
AF347015.2 | -0.49 | -0.42 |
AF347015.26 | -0.49 | -0.42 |
AF347015.15 | -0.48 | -0.42 |
AF347015.21 | -0.48 | -0.38 |
AF347015.33 | -0.48 | -0.43 |
MT-CO2 | -0.45 | -0.37 |
AF347015.27 | -0.45 | -0.41 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤IgG与IgA | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |