概括
基因 5670
象征 PSG2
同义词 CEA | PSBG2 | PSG1
描述 怀孕特异性β-1-糖蛋白2
参考 MIM:176391|HGNC:HGNC:9519|ENSEMBL:ENSG00000242221|HPRD:08891|Vega:Otthumg00000151547
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19Q13.1-Q13.2
Pascal P值 0.791
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PSG2 CHR19 43579615 C 一个 NM_031246 p.200r> s 错过 精神分裂症 DNM:XU_2012

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2682594 CHR19 43940775 PSG2 5670 0.19 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CHMP2A 0.82 0.82
COPS6 0.82 0.83
LSM4 0.80 0.83
hras 0.80 0.80
PSMD4 0.80 0.81
park7 0.80 0.80
AIP 0.79 0.82
RNF7 0.78 0.78
PHB 0.78 0.81
SSU72 0.77 0.72
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.52 -0.41
MT-ATP8 -0.52 -0.45
AF347015.8 -0.51 -0.41
AF347015.2 -0.49 -0.42
AF347015.26 -0.49 -0.42
AF347015.15 -0.48 -0.42
AF347015.21 -0.48 -0.38
AF347015.33 -0.48 -0.43
MT-CO2 -0.45 -0.37
AF347015.27 -0.45 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
奥多内尔转移 82 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgG与IgA 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因