基因页：PSMA3

概括?
基因ID 5684
Symbol PSMA3
同义词 HC8|PSC3
描述 蛋白酶体亚基α3
参考 MIM：176843|HGNC:HGNC:9532|Ensembl：ENSG00000100567|HPRD:01463|Vega:OTTHUMG00000140319
基因type protein-coding
地图位置 14Q23
Pascal P值 0.028
Sherlock P值 0.187

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.3285

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
RPN1 0.91 0.88
C22orf28 0.91 0.89
ARF4 0.90 0.90
ptges3 0.90 0.88
MRPL3 0.90 0.89
是的 0.90 0.89
WRB 0.90 0.92
ube2n 0.90 0.85
ASCC1 0.90 0.88
ABHD10 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
MT-CO2 -0.70 -0.74
AF347015.8 -0.69 -0.73
AF347015.33 -0.68 -0.72
MT-CYB -0.67 -0.72
AF347015.27 -0.66 -0.72
AF347015.15 -0.66 -0.73
AF347015.2 -0.66 -0.73
AF347015.21 -0.65 -0.70
AF347015.26 -0.65 -0.72
AF347015.31 -0.65 -0.71

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 14667819|15225636|15231747
|16169070
GO:0004298 threonine-type endopeptidase activity IEA -
GO:0008233 peptidase activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO：0031145 anaphase-promoting complex-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process EXP 11285280
GO:0051436 negative regulation of ubiquitin-protein ligase activity during mitotic cell cycle EXP 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 EXP 12791267
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol IEA -
去：0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
GO:0005856 cytoskeleton 艾达 18029348
GO:0005634 核 塔斯 16130169
GO:0005737 细胞质 塔斯 16130169

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
BAT2 D6S51 |D6S51E |DKFZP686D09175 |G2 HLA-B相关笔录2 - HPRD，Biogrid 14667819
CDKN1A CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (p21, Cip1) - HPRD，Biogrid 11350925
CRYAB crya2 |CTPP2 |HSPB5 crystallin, alpha B - HPRD，Biogrid 11341940
EGR1 AT225 |G0S30 |KROX-24 |ngfi-a |tis8 |ZIF-268 |ZNF225 early growth response 1 Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 12379479
PLK1 PLK |STPK13 polo-like kinase 1 (Drosophila) - HPRD，Biogrid 11205743
PSMA1 HC2 |MGC14542 |MGC14575 |MGC14751 |MGC1667 |MGC21459 |MGC22853 |MGC23915 |nu |PROS30 蛋白酶体（Prosome，宏观）亚基，Alpha型，1 - HPRD，Biogrid 9451443
PSMA6 IOTA | MGC22756 | MGC2333 | MGC23846 | PROS27 | p27K 蛋白酶体（Prosome，大型）亚基，α类型，6 Co-purification
两个杂交		 BioGRID 9451443|16169070
PSMD13 HSPC027 | Rpn9 | S11 | p40.5 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，13 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
SNRPB COD | SNRPB1 | SmB/SmB' | snRNP-B small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 两个杂交 BioGRID 16169070
SNRPF SMF 小型核核糖核蛋白多肽F 两个杂交 BioGRID 16169070
STX11 FHL4 | HLH4 | HPLH4 syntaxin 11 两个杂交 BioGRID 16169070
XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 - HPRD，Biogrid 15231747


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PROTEASOME 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta蛋白酶体途径 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid aurora b途径 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CROSS PRESENTATION OF SOLUBLE EXOGENOUS ANTIGENS ENDOSOMES 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING CROSS PRESENTATION 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ER吞噬体途径 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ORC1 REMOVAL FROM CHROMATIN 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 51 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CDK MEDIATED PHOSPHORYLATION AND REMOVAL OF CDC6 48 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF ORNITHINE DECARBOXYLASE ODC 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P53 DEPENDENT G1 DNA DAMAGE RESPONSE 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME M G1 TRANSITION 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 S TRANSITION 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF RNA 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY AUF1 HNRNP D0 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DNA REPLICATION 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME S PHASE 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME VIF MEDIATED DEGRADATION OF APOBEC3G 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MGUS VS PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH OCT4 TARGETS 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PROLIFERATION 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STARK PREFRONTAL CORTEX 22Q11 DELETION DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATTACHARYA EMBRYONIC STEM CELL 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX MULTIPLE MYELOMA BY TACI DN 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C0 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS INTERMEDIATE PROGENITOR 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEISS RESPONSE TO DSRNA UP 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MMS MOUSE LYMPH HIGH 4HRS UP 36 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 24 HR UP 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
老化老式的DN 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC UP 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因