基因页：SPHK2

概括？
基因 56848
象征 SPHK2
同义词 SK 2 | SK-2 | SPK 2 | SPK-2
描述 鞘氨醇激酶2
参考 MIM：607092|HGNC：HGNC：18859|Ensembl：ENSG0000000063176|HPRD：06157|Vega：Otthumg00000183318
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.061
胎儿β -0.59
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG11376305 19 49127510 SPHK2 2.56E-5 -0.44 0.017 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004143 二酰基甘油激酶活性 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 11777919
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
去：0008481 鞘氨酸激酶活性 nas 10751414
GO：0017016 RAS GTPase结合 nas 12391145
GO：0017050 D-鞘氨酸激酶活性 IEA -
去：0016301 激酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEA 大脑（GO期限：7） -
去：0001568 血管发育 IEA -
去：0007205 蛋白激酶C活性的激活 IEA -
去：0008283 细胞增殖 nas 10751414
去：0008284 细胞增殖的阳性调节 IEA -
去：0006669 鞘氨酸-1-磷酸生物合成过程 nas 10751414
去：0006670 鞘氨酸代谢过程 IEA -
去：0006916 抗凋亡 nas 10751414
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005829 细胞质 艾达 10751414
去：0005829 细胞质 IEA -
去：0005624 膜分数 艾达 10751414
去：0005624 膜分数 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg鞘脂代谢 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL12 2 Pathway 63 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID神经酰胺途径 48 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P META途径 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome鞘脂从头生物合成 31 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组鞘脂代谢 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB信号 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-130/301 494 501 1A，M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-137 583 589 M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-153 599 606 1A，M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-19 493 499 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-25/32/92/363/367 602 608 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-448 600 606 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau