基因页面:CELF4
总结吗?
| GeneID | 56853年 |
| 象征 | CELF4 |
| 同义词 | BRUNOL4 | CELF-4 |
| 描述 | CUGBP Elav-like家庭成员4 |
| 参考 | MIM: 612679|HGNC: HGNC: 14015|运用:ENSG00000101489|HPRD: 12534|织女:OTTHUMG00000178178 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 18日12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.183 |
| 夏洛克假定值 | 0.13 |
| 胎儿β | -1.535 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg00590960 | 18 | 35146726 | CELF4 | 6 e-9 | -0.016 | 3.2 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0000900 | 翻译阻遏活动,核酸绑定 | NAS | 10893231 | |
| 去:0003676 | 核酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042835 | BRE绑定 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007281 | 生殖细胞的发展 | NAS | 10893231 | |
| 去:0009790 | 胚胎发育 | NAS | 10893231 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯DN TP53的目标 | 593年 | 372年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53目标DN | 591年 | 366年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 129 - 5 - p | 659年 | 665年 | 1 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC | ||||
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC | ||||
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| mir - 133 | 516年 | 522年 | 1 | hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU |
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU | ||||
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| mir - 190 | 129年 | 136年 | 1、m8 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
| mir - 330 | 750年 | 756年 | 1 | hsa - mir - 330大脑 | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
| mir - 376 | 623年 | 630年 | 1、m8 | hsa - mir - 376 a | AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU |
| hsa - mir - 376 b | AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU | ||||
| mir - 450 | 1059年 | 1065年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |
| miR-9 | 510年 | 516年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |