基因页:PSMA6
概括?
基因 | 5687 |
象征 | PSMA6 |
同义词 | iota | pros27 | p27k |
描述 | 蛋白酶体亚基6 |
参考 | MIM:602855|HGNC:HGNC:9535|ENSEMBL:ENSG00000100902|HPRD:04171|Vega:Otthumg00000140221 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q13 |
Pascal P值 | 5.675E-4 |
Sherlock P值 | 0.053 |
胎儿β | 0.526 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0044 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CCT7 | 0.92 | 0.94 |
DCTN2 | 0.92 | 0.92 |
trappc3 | 0.92 | 0.91 |
PSMA7 | 0.91 | 0.92 |
EIF2B3 | 0.91 | 0.91 |
dguok | 0.91 | 0.92 |
PSMB7 | 0.91 | 0.93 |
VDAC2 | 0.91 | 0.88 |
EIF5A | 0.91 | 0.92 |
eapp | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.78 | -0.80 |
mt-cyb | -0.77 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.80 |
AF347015.15 | -0.77 | -0.81 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.80 |
AF347015.2 | -0.76 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.76 | -0.77 |
AF347015.26 | -0.76 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.76 |
AF347015.9 | -0.70 | -0.78 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003723 | RNA结合 | nas | 7681138 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15225636|16169070 | |
去:0004298 | 苏氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | nas | - | |
GO:0031145 | 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 | 经验 | 11285280 | |
GO:0051436 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的负调控 | 经验 | 15029244 | |
GO:0051437 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 | 经验 | 12791267 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005839 | 蛋白酶体核心复合物 | IEA | - | |
去:0005839 | 蛋白酶体核心复合物 | nas | 1888762 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg蛋白酶体 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta蛋白酶体途径 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工交叉呈现 | 76 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ER吞噬体途径 | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ORC1从染色质中去除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 | 51 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 | 48 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
凋亡的反应组调节 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome M G1过渡 | 81 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
复制前复合物的反应组装 | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome VIF介导的apobec3g降解 | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
怀特赫斯特紫杉醇敏感性 | 39 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
golub所有vs aml up | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
石匠食道癌发生 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C1的反应 | 72 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |