概括
基因 5687
象征 PSMA6
同义词 iota | pros27 | p27k
描述 蛋白酶体亚基6
参考 MIM:602855|HGNC:HGNC:9535|ENSEMBL:ENSG00000100902|HPRD:04171|Vega:Otthumg00000140221
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q13
Pascal P值 5.675E-4
Sherlock P值 0.053
胎儿β 0.526

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0044

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCT7 0.92 0.94
DCTN2 0.92 0.92
trappc3 0.92 0.91
PSMA7 0.91 0.92
EIF2B3 0.91 0.91
dguok 0.91 0.92
PSMB7 0.91 0.93
VDAC2 0.91 0.88
EIF5A 0.91 0.92
eapp 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.78 -0.80
mt-cyb -0.77 -0.81
AF347015.27 -0.77 -0.80
AF347015.15 -0.77 -0.81
AF347015.33 -0.77 -0.80
AF347015.2 -0.76 -0.82
MT-CO2 -0.76 -0.77
AF347015.26 -0.76 -0.82
AF347015.31 -0.73 -0.76
AF347015.9 -0.70 -0.78

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003723 RNA结合 nas 7681138
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15225636|16169070
去:0004298 苏氨酸型内肽酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 nas -
GO:0031145 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 经验 11285280
GO:0051436 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的负调控 经验 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 经验 12791267
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 IEA -
去:0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
去:0005839 蛋白酶体核心复合物 nas 1888762
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005739 线粒体 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg蛋白酶体 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta蛋白酶体途径 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工交叉呈现 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ER吞噬体途径 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ORC1从染色质中去除 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞中NF Kappab的反应组激活 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 51 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 48 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期检查点 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome M G1过渡 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1 S过渡 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
复制前复合物的反应组装 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome VIF介导的apobec3g降解 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特赫斯特紫杉醇敏感性 39 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
golub所有vs aml up 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
石匠食道癌发生 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
takao对UVB辐射的响应 86 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C1的反应 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级转移DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因