基因页：anks1b
概括？
| 基因 | 56899 |
| 象征 | anks1b |
| 同义词 | AIDA | AIDA-1 | ANKS2 | EB-1 | EB1 | CAJALIN-2 |
| 描述 | Ankyrin重复和无菌α基序包含1B |
| 参考 | MIM：607815|HGNC：HGNC：24600|Ensembl：ENSG00000185046|HPRD：07426|Vega：Otthumg00000170308 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12q23.1 |
| Pascal P值 | 2.02E-6 |
| Sherlock P值 | 0.652 |
| 胎儿β | 2.045 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.1108 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG25401219 | 12 | 100247193 | anks1b | 3.39e-5 | 0.254 | 0.019 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon（GO术语级别：4） | - |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由EWS FLT1融合绑定的Siligan | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delaserna Myod的目标 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和替代剪接 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 26 | 32 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-186 | 1147 | 1153 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| mir-208 | 1348 | 1354 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
| mir-214 | 953 | 959 | M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
| mir-26 | 1511 | 1518年 | 1A，M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
| mir-330 | 302 | 308 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-34b | 382 | 389 | 1A，M8 | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |
| mir-381 | 682 | 688 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
| mir-410 | 1227 | 1233 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
| mir-485-3p | 1190 | 1196 | M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
| mir-494 | 755 | 761 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |
| HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu | ||||
| mir-499 | 1348 | 1354 | 1a | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |
| mir-543 | 707 | 713 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |