Gene Page:PSMB2
概括?
基因 | 5690 |
象征 | PSMB2 |
Synonyms | HC7-I |
Description | proteasome subunit beta 2 |
Reference | MIM:602175|HGNC:HGNC:9539|Ensembl:ENSG00000126067|HPRD:03708| |
Gene type | protein-coding |
Map location | 1p34.2 |
Pascal p-value | 2.399E-5 |
Fetal beta | 0.573 |
eGene | Myers' cis & trans |
数据源中的基因
Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
---|---|---|---|
CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
PMID:cooccur | High-throughput literature-search | 系统的搜索in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
eQTL annotation
SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
snp_a-1856993 | 0 | PSMB2 | 5690 | 0.12 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PSMB2_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
No co-expressed genes in brain regions
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
---|---|---|---|
KEGG PROTEASOME | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA PROTEASOME PATHWAY | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CROSS PRESENTATION OF SOLUBLE EXOGENOUS ANTIGENS ENDOSOMES | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ANTIGEN PROCESSING CROSS PRESENTATION | 76 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ER PHAGOSOME PATHWAY | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ORC1 REMOVAL FROM CHROMATIN | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY THE B CELL RECEPTOR BCR | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME P53 INDEPENDENT G1 S DNA DAMAGE CHECKPOINT | 51 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CDK MEDIATED PHOSPHORYLATION AND REMOVAL OF CDC6 | 48 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME REGULATION OF ORNITHINE DECARBOXYLASE ODC | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME REGULATION OF APOPTOSIS | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CYCLIN E ASSOCIATED EVENTS DURING G1 S TRANSITION | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME P53 DEPENDENT G1 DNA DAMAGE RESPONSE | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME M G1 TRANSITION | 81 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME G1 S TRANSITION | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CDT1 ASSOCIATION WITH THE CDC6 ORC ORIGIN COMPLEX | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME AUTODEGRADATION OF THE E3 UBIQUITIN LIGASE COP1 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF MRNA | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF RNA | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME REGULATION OF MITOTIC CELL CYCLE | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME REGULATION OF MRNA STABILITY BY PROTEINS THAT BIND AU RICH ELEMENTS | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY AUF1 HNRNP D0 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DNA REPLICATION | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HIV INFECTION | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HOST INTERACTIONS OF HIV FACTORS | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME APC C CDC20 MEDIATED DEGRADATION OF MITOTIC PROTEINS | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME AUTODEGRADATION OF CDH1 BY CDH1 APC C | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME S PHASE | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME VIF MEDIATED DEGRADATION OF APOBEC3G | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BERTUCCI MEDULLARY VS DUCTAL BREAST CANCER UP | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 16D DN | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HAHTOLA SEZARY SYNDROM UP | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BASSO B LYMPHOCYTE NETWORK | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FERRANDO T ALL WITH MLL ENL FUSION DN | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC和多能祖先 | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHU CMV ALL UP | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS UP | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄蛋白酶体基因模块 | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAIRKEE CANCER PRONE RESPONSE BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHUNG BLISTER CYTOTOXICITY UP | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO HOUSEKEEPING GENES | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE 2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |