Summary
基因ID 5691
Symbol PSMB3
同义词 HC10-II
描述 蛋白酶体亚基β3
参考 MIM:602176|HGNC:HGNC:9540|Ensembl:ENSG00000277791|HPRD:03709|Vega:Otthumg00000188503
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 1.819的军医
夏洛克假定值 0.106

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0113

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP11-208G20.1 0.86 0.72
glo1 0.73 0.66
SRI 0.73 0.65
TMEM14B 0.73 0.60
adk 0.72 0.70
GBAS 0.70 0.61
SELT 0.70 0.58
IFNGR1 0.70 0.51
0.70 0.67
rwdd2b 0.70 0.62
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C9orf131 -0.32 -0.34
BAT2D1 -0.30 -0.24
HSP90AB4P -0.28 -0.33
SPDYE5 -0.28 -0.34
grin2b -0.28 -0.18
mupcdh -0.28 -0.42
C10orf108 -0.27 -0.27
AC010300.1 -0.27 -0.22
SIRPB1 -0.27 -0.34
AL031587.2 -0.27 -0.30

第三节。基因本体论注释

Molecular function 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
GO:0004298 苏氨酸型内肽酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO:0031145 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 EXP 11285280
GO:0051436 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的负调控 EXP 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 EXP 12791267
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0005829 细胞质 IEA -
GO:0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005737 cytoplasm IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg蛋白酶体 48 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta蛋白酶体途径 28 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY WNT 65 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 48 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome抗原加工交叉呈现 76 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME ER PHAGOSOME PATHWAY 61 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞周期 421 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome ORC1从染色质中去除 67 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
B细胞中NF Kappab的反应组激活 64 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 51 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 48 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 49 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
凋亡的反应组调节 58 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞周期CHECKPOINTS 124 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 57 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome M G1过渡 81 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome G1 S过渡 112 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SYNTHESIS OF DNA 92 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
mRNA的反应组代谢 284 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
READEM RNA的代谢 330 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 137 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME REGULATION OF MITOTIC CELL CYCLE 85 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 65 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 53 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome DNA复制 192 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME APOPTOSIS 148 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome HIV感染 207 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME HOST INTERACTIONS OF HIV FACTORS 132 81 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 72 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome适应性免疫系统 539 350 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome s阶段 109 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 56 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome VIF介导的apobec3g降解 52 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
hahtola sezary综合征 98 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP 177 113 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Midorikawa在肝癌中扩增 55 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PENG GLUTAMINE DEPRIVATION DN 337 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kaab失败的心房DN 141 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
朗布浓缩学习环境迟到 22 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION UP 64 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WONG PROTEASOME GENE MODULE 49 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRADE COLON AND RECTAL CANCER UP 285 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi Plasmacytoma dn 100 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOSHIDA LIVER CANCER LATE RECURRENCE DN 69 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌生存DN 113 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hahtola CTCL皮肤 26 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway