概括
基因 56910
象征 Stard7
同义词 GTT1
描述 符合7的星际相关脂质转移域
参考 MIM:616712|HGNC:HGNC:18063|ENSEMBL:ENSG00000084090|HPRD:18118|Vega:Otthumg00000130457
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 3.715e-5
Sherlock P值 0.242
胎儿β -0.168
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04018571 2 96874059 Stard7 2.098E-4 -0.191 0.035 DMG:Wockner_2014
CG05261289 2 96874823 Stard7 -0.032 0.3 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meinhold卵巢癌低级DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的肌肉 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)的靶向对雌激素的反应 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 332 339 1A,M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-124/506 503 509 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 1815年 1821年 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-27 1815年 1821年 M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-335 448 454 M8 HSA-MIR-335 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU
mir-377 1835年 1842年 1A,M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-96 1447 1453 M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc