概括
基因 56915
象征 exosc5
同义词 rrp41b | rrp46 | rrp46p | hrrp46p | p12b
描述 外泌体组件5
参考 MIM:606492|HGNC:HGNC:24662|Ensembl:ENSG00000077348|HPRD:16222|Vega:Otthumg00000182759
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.1
Pascal P值 0.104
Sherlock P值 0.047
胎儿β 0.052
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
exosc1 CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 外泌体组件1 HCSL4P与HRRP46P相互作用。 绑定 11812149
exosc1 CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 外泌体组件1 - HPRD,Biogrid 11110791|12419256 | 11812149
|12419256
exosc1 CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 外泌体组件1 HRRP46P与HCSL4P相互作用。 绑定 12419256
Exosc10 PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 外泌体组件10 - HPRD 15231747
exosc3 CGI-102 |MGC15120 |MGC723 |RP11-3J10.8 |RRP40 |RRP40P |BA3J10.7 |HRRP40P |P10 外泌体组件3 - HPRD 11110791|12419256 | 12419256
exosc3 CGI-102 |MGC15120 |MGC723 |RP11-3J10.8 |RRP40 |RRP40P |BA3J10.7 |HRRP40P |P10 外泌体组件3 HRRP40P与HRRP46P相互作用。 绑定 12419256
exosc8 CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 外泌体组件8 HRRP46P与OIP2相互作用。 绑定 12419256
exosc8 CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 外泌体组件8 - HPRD 12419256
KIAA1217 DKFZP761L0424 |MGC31990 |skt KIAA1217 两个杂交 Biogrid 16189514
LSM5 FLJ12710 |yer146w LSM5同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) - HPRD,Biogrid 15231747
NUP210 FLJ22389 |GP210 |KIAA0906 |POM210 核孔蛋白210KDA - HPRD,Biogrid 15231747
PA2G4 EBP1 |HG4-1 |P38-2G4 增殖相关2G4,38KDA - HPRD 15231747
PKM2 CTHBP |MGC3932 |OIP3 |PK3 |PKM |TCB |THBP1 丙酮酸激酶,肌肉 - HPRD,Biogrid 15231747
polr2l RBP10 |RPABC5 |RPB10 |rpb10beta |RPB7.6 |HRPB7.6 |HSRPB10B 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽L,7.6KDA - HPRD 15231747
SFPQ POMP100 |PSF 剪接因子蛋白酶/谷氨酰胺富含丙酸酯(息肉嘧啶裂纹结合蛋白) - HPRD,Biogrid 15231747
ZNF558 FLJ30932 锌指蛋白558 - HPRD 15231747


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG RNA降解 59 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Perk调控基因表达 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF4对基因激活的反应组激活 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA衰减3至5个驱虫核酸酶 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRF1对mRNA的反应组不稳定 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KSRP对mRNA的反应组不稳定 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tristraprolin TTP对mRNA的反应组不稳定 17 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期24小时 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因