基因页:exosc5
概括?
基因 | 56915 |
象征 | exosc5 |
同义词 | rrp41b | rrp46 | rrp46p | hrrp46p | p12b |
描述 | 外泌体组件5 |
参考 | MIM:606492|HGNC:HGNC:24662|Ensembl:ENSG00000077348|HPRD:16222|Vega:Otthumg00000182759 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.1 |
Pascal P值 | 0.104 |
Sherlock P值 | 0.047 |
胎儿β | 0.052 |
主持人 | 小脑 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EXOSC5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
exosc1 | CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 | 外泌体组件1 | HCSL4P与HRRP46P相互作用。 | 绑定 | 11812149 |
exosc1 | CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 | 外泌体组件1 | - | HPRD,Biogrid | 11110791|12419256 | 11812149 |12419256 |
exosc1 | CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 | 外泌体组件1 | HRRP46P与HCSL4P相互作用。 | 绑定 | 12419256 |
Exosc10 | PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 | 外泌体组件10 | - | HPRD | 15231747 |
exosc3 | CGI-102 |MGC15120 |MGC723 |RP11-3J10.8 |RRP40 |RRP40P |BA3J10.7 |HRRP40P |P10 | 外泌体组件3 | - | HPRD | 11110791|12419256 | 12419256 |
exosc3 | CGI-102 |MGC15120 |MGC723 |RP11-3J10.8 |RRP40 |RRP40P |BA3J10.7 |HRRP40P |P10 | 外泌体组件3 | HRRP40P与HRRP46P相互作用。 | 绑定 | 12419256 |
exosc8 | CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 | 外泌体组件8 | HRRP46P与OIP2相互作用。 | 绑定 | 12419256 |
exosc8 | CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 | 外泌体组件8 | - | HPRD | 12419256 |
KIAA1217 | DKFZP761L0424 |MGC31990 |skt | KIAA1217 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
LSM5 | FLJ12710 |yer146w | LSM5同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) | - | HPRD,Biogrid | 15231747 |
NUP210 | FLJ22389 |GP210 |KIAA0906 |POM210 | 核孔蛋白210KDA | - | HPRD,Biogrid | 15231747 |
PA2G4 | EBP1 |HG4-1 |P38-2G4 | 增殖相关2G4,38KDA | - | HPRD | 15231747 |
PKM2 | CTHBP |MGC3932 |OIP3 |PK3 |PKM |TCB |THBP1 | 丙酮酸激酶,肌肉 | - | HPRD,Biogrid | 15231747 |
polr2l | RBP10 |RPABC5 |RPB10 |rpb10beta |RPB7.6 |HRPB7.6 |HSRPB10B | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽L,7.6KDA | - | HPRD | 15231747 |
SFPQ | POMP100 |PSF | 剪接因子蛋白酶/谷氨酰胺富含丙酸酯(息肉嘧啶裂纹结合蛋白) | - | HPRD,Biogrid | 15231747 |
ZNF558 | FLJ30932 | 锌指蛋白558 | - | HPRD | 15231747 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Perk调控基因表达 | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF4对基因激活的反应组激活 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA衰减3至5个驱虫核酸酶 | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRF1对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KSRP对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tristraprolin TTP对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期24小时 | 43 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |