基因页：PSMB5

概括?
基因ID 5693
Symbol PSMB5
同义词 LMPX|MB1|X
描述 proteasome subunit beta 5
参考 MIM:600306|HGNC:HGNC:9542|Ensembl:ENSG00000100804|HPRD:02629|Vega：Otthumg0000000028713
基因type protein-coding
地图位置 14q11.2
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 0.099
eGene Cerebellum
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS7132043 chr12 80968399 PSMB5 5693 0.08 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
TP53 0.95 0.88
TGIF2 0.95 0.80
CDK2 0.94 0.71
TCF3 0.94 0.88
NCAPD2 0.93 0.79
EPHB4 0.93 0.82
MCM5 0.93 0.82
FOXM1 0.93 0.78
MCM2 0.93 0.75
永恒 0.92 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
C5orf53 -0.48 -0.66
AF347015.27 -0.42 -0.62
AF347015.31 -0.42 -0.62
CA4 -0.41 -0.53
MT-CO2 -0.41 -0.62
S100B -0.40 -0.54
MYL3 -0.40 -0.59
IFI27 -0.40 -0.55
AF347015.33 -0.40 -0.57
ACYP2 -0.40 -0.53

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15231747|17353931
GO:0004298 threonine-type endopeptidase activity IEA -
GO:0008233 peptidase activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO:0006979 response to oxidative stress IEA -
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process EXP 11285280
GO:0051436 negative regulation of ubiquitin-protein ligase activity during mitotic cell cycle EXP 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 EXP 12791267
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol IEA -
去：0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PROTEASOME 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta蛋白酶体途径 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CROSS PRESENTATION OF SOLUBLE EXOGENOUS ANTIGENS ENDOSOMES 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING CROSS PRESENTATION 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ER吞噬体途径 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ORC1 REMOVAL FROM CHROMATIN 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P53 INDEPENDENT G1 S DNA DAMAGE CHECKPOINT 51 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CDK MEDIATED PHOSPHORYLATION AND REMOVAL OF CDC6 48 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF ORNITHINE DECARBOXYLASE ODC 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P53 DEPENDENT G1 DNA DAMAGE RESPONSE 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME M G1 TRANSITION 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 S TRANSITION 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF RNA 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY AUF1 HNRNP D0 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DNA REPLICATION 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDC20 MEDIATED DEGRADATION OF MITOTIC PROTEINS 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME S PHASE 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME VIF MEDIATED DEGRADATION OF APOBEC3G 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS CDC25 UP 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA COLON CANCER MSI UP 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAERVINEN AMPLIFIED IN LARYNGEAL CANCER 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA HIF1A UP 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
切斯勒大脑最高表达 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB FAILED HEART ATRIUM DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARIADASON RESPONSE TO CURCUMIN SULINDAC 5 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND MACROPHAGE 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 UP 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍少突细胞麻木ER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因