基因页：NIT2
概括？
| 基因 | 56954 |
| 象征 | NIT2 |
| 同义词 | HEL-S-8A |
| 描述 | 硝酸酶家庭成员2 |
| 参考 | MIM：616769|HGNC：HGNC：29878|HPRD：17634| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q12.2 |
| Pascal P值 | 0.991 |
| Sherlock P值 | 0.599 |
| 胎儿β | -0.577 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.04047 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04359 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03429645 | 3 | 100053188 | NIT2 | 1.238E-4 | 0.588 | 0.03 | DMG：Wockner_2014 |
| CG24147849 | 3 | 100053372 | NIT2 | 1.03E-8 | -0.022 | 4.45e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS9729667 | CHR1 | 78349213 | NIT2 | 56954 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16848937 | CHR2 | 213482087 | NIT2 | 56954 | 0.2 | 反式 | ||
| RS1697139 | CHR5 | 66511534 | NIT2 | 56954 | 0.15 | 反式 | ||
| RS10850170 | CHR12 | 114031245 | NIT2 | 56954 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7649598 | 3 | 100053083 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 4.882e-9 | 0 | -462 | gtex_brain_ba24 |
| RS11714045 | 3 | 100055125 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.162E-8 | 0 | 1580 | gtex_brain_ba24 |
| RS59560200 | 3 | 100059518 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.141E-8 | 0 | 5973 | gtex_brain_ba24 |
| RS35945684 | 3 | 100059666 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.31E-8 | 0 | 6121 | gtex_brain_ba24 |
| RS395399 | 3 | 100064005 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.663E-7 | 0 | 10460 | gtex_brain_ba24 |
| RS1045206 | 3 | 100064741 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.108E-7 | 0 | 11196 | gtex_brain_ba24 |
| RS2289505 | 3 | 100064829 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.162E-8 | 0 | 11284 | gtex_brain_ba24 |
| RS2289506 | 3 | 100064902 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.162E-8 | 0 | 11357 | gtex_brain_ba24 |
| RS1214375 | 3 | 100065632 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.086E-7 | 0 | 12087 | gtex_brain_ba24 |
| RS13082297 | 3 | 100071070 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.169E-8 | 0 | 17525 | gtex_brain_ba24 |
| RS62274146 | 3 | 100076980 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.016E-6 | 0 | 23435 | gtex_brain_ba24 |
| RS62274147 | 3 | 100091116 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 37571 | gtex_brain_ba24 |
| RS1486308 | 3 | 100093054 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 39509 | gtex_brain_ba24 |
| RS13071905 | 3 | 100094154 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.033E-6 | 0 | 40609 | gtex_brain_ba24 |
| RS13073252 | 3 | 100094208 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.033E-6 | 0 | 40663 | gtex_brain_ba24 |
| RS4928123 | 3 | 100094524 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 40979 | gtex_brain_ba24 |
| RS397788359 | 3 | 100100774 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.146E-6 | 0 | 47229 | gtex_brain_ba24 |
| RS3772693 | 3 | 100104114 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.112E-6 | 0 | 50569 | gtex_brain_ba24 |
| RS35281373 | 3 | 100111071 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 57526 | gtex_brain_ba24 |
| RS34645158 | 3 | 100111246 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 57701 | gtex_brain_ba24 |
| RS2289502 | 3 | 100121140 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.154E-6 | 0 | 67595 | gtex_brain_ba24 |
| RS4441690 | 3 | 100131897 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.079E-6 | 0 | 78352 | gtex_brain_ba24 |
| RS756103 | 3 | 100131976 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.102E-6 | 0 | 78431 | gtex_brain_ba24 |
| RS4928125 | 3 | 100141714 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.383E-6 | 0 | 88169 | gtex_brain_ba24 |
| RS11714045 | 3 | 100055125 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 6.423e-9 | 0 | 1580 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS59560200 | 3 | 100059518 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.093E-9 | 0 | 5973 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35945684 | 3 | 100059666 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.246E-9 | 0 | 6121 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62274141 | 3 | 100060779 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 8.78e-7 | 0 | 7234 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2289505 | 3 | 100064829 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 6.423e-9 | 0 | 11284 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2289506 | 3 | 100064902 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 6.423e-9 | 0 | 11357 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13082297 | 3 | 100071070 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 6.423e-9 | 0 | 17525 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62274146 | 3 | 100076980 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 2.521E-8 | 0 | 23435 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62274147 | 3 | 100091116 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 5.822e-8 | 0 | 37571 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1486308 | 3 | 100093054 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 5.846e-8 | 0 | 39509 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13071905 | 3 | 100094154 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 5.854e-8 | 0 | 40609 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS13073252 | 3 | 100094208 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 5.854e-8 | 0 | 40663 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4928123 | 3 | 100094524 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 5.854e-8 | 0 | 40979 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS397788359 | 3 | 100100774 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.994e-8 | 0 | 47229 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3772693 | 3 | 100104114 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.838e-8 | 0 | 50569 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35281373 | 3 | 100111071 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.836e-8 | 0 | 57526 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34645158 | 3 | 100111246 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.836e-8 | 0 | 57701 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2289502 | 3 | 100121140 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.685e-8 | 0 | 67595 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4441690 | 3 | 100131897 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.437E-8 | 0 | 78352 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS756103 | 3 | 100131976 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.454e-8 | 0 | 78431 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4928124 | 3 | 100136644 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.554E-7 | 0 | 83099 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4928125 | 3 | 100141714 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 3.227E-8 | 0 | 88169 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35925258 | 3 | 100173850 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 8.446e-7 | 0 | 120305 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55819532 | 3 | 100180901 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.097E-6 | 0 | 127356 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34064933 | 3 | 100183546 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.011E-6 | 0 | 130001 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10936205 | 3 | 100187904 | NIT2 | ENSG00000114021.7 | 1.766E-6 | 0 | 134359 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| GO：0016810 | 水解酶活性，作用于碳氮（而非肽）键 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008150 | 生物_Process | nd | - | |
| 去：0006807 | 氮化代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |