基因页：PSMB8

概括?
基因ID 5696
Symbol PSMB8
同义词 Aldd | D6S216 | D6S216E | JMP | LMP7 | NKJO | PSMB5I | RING10
描述 proteasome subunit beta 8
参考 MIM:177046|HGNC:HGNC:9545|Ensembl:ENSG00000204264|HPRD:01515|Vega:OTTHUMG00000031285
基因type protein-coding
地图位置 6p21.3
Pascal P值 7.378E-9
Sherlock P值 0.097
Fetal beta -1.608
DMG 2（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Meta

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
CV：GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 2
DMG:Montano_2016 Genome-wide DNA methylation analysis 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG19190163 6 32810785 PSMB8 1.63E-4 -0.007 0.143 DMG:Montano_2016
CG10128166 6 32812221 PSMB8 1.3E-8 -0.016 5.2E-6 DMG:Jaffe_2016

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs17061055 chr13 40835399 PSMB8 5696 0.18 trans
RS16979927 chr20 55019249 PSMB8 5696 0.02 trans
RS4501739 chrX 35960848 PSMB8 5696 0.03 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
Azin1 0.93 0.94
TXNDC16 0.93 0.94
KPNA4 0.92 0.94
TBC1D23 0.92 0.93
ube3a 0.92 0.94
FYTTD1 0.92 0.93
ATF2 0.92 0.93
IPO7 0.92 0.93
USP33 0.92 0.94
CUL4B 0.92 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
FXYD1 -0.73 -0.78
MT-CO2 -0.70 -0.77
AF347015.33 -0.69 -0.74
AF347015.31 -0.68 -0.74
AF347015.8 -0.68 -0.75
higd1b -0.67 -0.74
AC018755.7 -0.67 -0.72
MT-CYB -0.66 -0.72
ROM1 -0.66 -0.72
AF347015.27 -0.66 -0.72

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15231747
GO:0004298 threonine-type endopeptidase activity IEA -
GO:0008233 peptidase activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO:0006955 immune response IEA -
GO：0031145 anaphase-promoting complex-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process EXP 11285280
GO:0051436 negative regulation of ubiquitin-protein ligase activity during mitotic cell cycle EXP 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 EXP 12791267
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol IEA -
去：0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PROTEASOME 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CROSS PRESENTATION OF SOLUBLE EXOGENOUS ANTIGENS ENDOSOMES 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING CROSS PRESENTATION 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ER吞噬体途径 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ORC1 REMOVAL FROM CHROMATIN 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 51 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CDK MEDIATED PHOSPHORYLATION AND REMOVAL OF CDC6 48 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF ORNITHINE DECARBOXYLASE ODC 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P53 DEPENDENT G1 DNA DAMAGE RESPONSE 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME M G1 TRANSITION 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 S TRANSITION 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF RNA 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON ALPHA BETA SIGNALING 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DESTABILIZATION OF MRNA BY AUF1 HNRNP D0 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DNA REPLICATION 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME S PHASE 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME VIF MEDIATED DEGRADATION OF APOBEC3G 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASTELLANO NRAS TARGETS UP 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG BARRETTS ESOPHAGUS AND ESOPHAGUS CANCER UP 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bowie对细胞外基质的反应 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOYAMA SEMA3B TARGETS UP 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jeon Smad6靶向 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DER IFN ALPHA RESPONSE UP 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn伽马响应 71 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABBUD LIF SIGNALING 1 UP 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU TNF SIGNALING 4HR 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING MUSCLE DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG PROTEASOME GENE MODULE 49 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WUNDER INFLAMMATORY RESPONSE AND CHOLESTEROL UP 58 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS UP 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 9 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAUS TFF2 TARGETS UP 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 1HR DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS UP 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG GATA2 TARGETS UP 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因