概括
基因 5698
象征 PSMB9
同义词 lmp2 | psmb6i | ring12 | beta1i
描述 蛋白酶体亚基β9
参考 MIM:177045|HGNC:HGNC:9546|HPRD:01514|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 5.676E-8
Sherlock P值 0.744
DMG 3(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 5
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 5
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 5
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12762680 6 32822346 PSMB9; TAP1 2.498E-4 -0.493 0.037 DMG:Wockner_2014
CG13869180 6 32827216 PSMB9 3.329E-4 0.564 0.041 DMG:Wockner_2014
CG07504780 6 32821684 PSMB9 -0.021 0.41 DMG:Nishioka_2013
CG17138984 6 32862236 PSMB9 5.13e-10 -0.014 8.65e-7 DMG:JAFFE_2016
CG04347293 6 32862350 PSMB9 1.62E-8 -0.012 5.99E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PAQR6 0.86 0.89
MVP 0.85 0.88
plekhb1 0.84 0.88
S100A1 0.84 0.90
CSRP1 0.84 0.89
HLA-F 0.83 0.87
CYP27A1 0.83 0.87
HPN 0.83 0.87
plekhf1 0.83 0.83
PLA2G16 0.82 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkiras2 -0.74 -0.78
GSTA4 -0.73 -0.80
DUSP12 -0.72 -0.79
珀格 -0.72 -0.77
BLMH -0.72 -0.77
PARP6 -0.72 -0.77
ZNF821 -0.72 -0.76
标记3 -0.71 -0.75
PJA1 -0.71 -0.75
DNAJC9 -0.71 -0.74

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004298 苏氨酸型内肽酶活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
去:0006955 免疫反应 IEA -
GO:0031145 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 经验 11285280
GO:0051436 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的负调控 经验 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 经验 12791267
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 IEA -
去:0005839 蛋白酶体核心复合物 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg蛋白酶体 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工交叉呈现 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ER吞噬体途径 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ORC1从染色质中去除 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞中NF Kappab的反应组激活 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 51 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 48 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期检查点 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome M G1过渡 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1 S过渡 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
复制前复合物的反应组装 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 53 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 73 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 64 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome VIF介导的apobec3g降解 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射6的响应6 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bowie对细胞外基质的反应 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dirmeier LMP1响应晚期DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
furukawa dusp6靶向pci35 74 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn alpha响应 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn伽马响应 71 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移 79 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU对维甲酸的反应 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗干扰素反应性基因 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
停放APL发病机理 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
炎症反应和胆固醇 58 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌后期复发 62 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇9的时间反应9 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baus TFF2靶向 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因