基因页:PSMB9
概括?
基因 | 5698 |
象征 | PSMB9 |
同义词 | lmp2 | psmb6i | ring12 | beta1i |
描述 | 蛋白酶体亚基β9 |
参考 | MIM:177045|HGNC:HGNC:9546|HPRD:01514| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 5.676E-8 |
Sherlock P值 | 0.744 |
DMG | 3(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 5 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 5 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 5 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12762680 | 6 | 32822346 | PSMB9; TAP1 | 2.498E-4 | -0.493 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
CG13869180 | 6 | 32827216 | PSMB9 | 3.329E-4 | 0.564 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
CG07504780 | 6 | 32821684 | PSMB9 | -0.021 | 0.41 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG17138984 | 6 | 32862236 | PSMB9 | 5.13e-10 | -0.014 | 8.65e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
CG04347293 | 6 | 32862350 | PSMB9 | 1.62E-8 | -0.012 | 5.99E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PSMB9_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PAQR6 | 0.86 | 0.89 |
MVP | 0.85 | 0.88 |
plekhb1 | 0.84 | 0.88 |
S100A1 | 0.84 | 0.90 |
CSRP1 | 0.84 | 0.89 |
HLA-F | 0.83 | 0.87 |
CYP27A1 | 0.83 | 0.87 |
HPN | 0.83 | 0.87 |
plekhf1 | 0.83 | 0.83 |
PLA2G16 | 0.82 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nkiras2 | -0.74 | -0.78 |
GSTA4 | -0.73 | -0.80 |
DUSP12 | -0.72 | -0.79 |
珀格 | -0.72 | -0.77 |
BLMH | -0.72 | -0.77 |
PARP6 | -0.72 | -0.77 |
ZNF821 | -0.72 | -0.76 |
标记3 | -0.71 | -0.75 |
PJA1 | -0.71 | -0.75 |
DNAJC9 | -0.71 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004298 | 苏氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
GO:0031145 | 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 | 经验 | 11285280 | |
GO:0051436 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的负调控 | 经验 | 15029244 | |
GO:0051437 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 | 经验 | 12791267 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005839 | 蛋白酶体核心复合物 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg蛋白酶体 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工交叉呈现 | 76 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ER吞噬体途径 | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ORC1从染色质中去除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 | 51 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 | 48 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
凋亡的反应组调节 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome M G1过渡 | 81 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
复制前复合物的反应组装 | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome VIF介导的apobec3g降解 | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues DCC目标DN | 121 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射6的响应6 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bowie对细胞外基质的反应 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dirmeier LMP1响应晚期DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn alpha响应 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HBV感染的Wieland | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn伽马响应 | 71 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU对维甲酸的反应 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗干扰素反应性基因 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krasnoselskaya ILF3靶向 | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
huper乳房基础与腔内DN | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP | 107 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
停放APL发病机理 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
炎症反应和胆固醇 | 58 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Vav3前列腺致癌作用 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌后期复发 | 62 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存 | 73 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇9的时间反应9 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baus TFF2靶向 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Glis2靶向 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |