基因页：PSMC3
概括？
| 基因 | 5702 |
| 象征 | PSMC3 |
| 同义词 | TBP1 |
| 描述 | 蛋白酶体26S亚基，ATPase 3 |
| 参考 | MIM：186852|HGNC：HGNC：9549|ENSEMBL：ENSG00000165916|HPRD：01733|Vega：Otthumg00000167692 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P11.2 |
| Pascal P值 | 0.023 |
| Sherlock P值 | 0.595 |
| 胎儿β | -0.322 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 元 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.01 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08722104 | 11 | 47448306 | PSMC3 | 3.73E-10 | -0.019 | 7.47E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG23920472 | 11 | 47448172 | PSMC3 | 1.09E-8 | -0.011 | 4.61E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4752918 | 11 | 48253251 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 3.201E-6 | 0.01 | -805258 | gtex_brain_ba24 |
| RS4500448 | 11 | 48253520 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 2.606E-6 | 0.01 | -805527 | gtex_brain_ba24 |
| RS10838838 | 11 | 48253895 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 2.576E-6 | 0.01 | -805902 | gtex_brain_ba24 |
| RS11039600 | 11 | 48254551 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 4.048e-6 | 0.01 | -806558 | gtex_brain_ba24 |
| RS7395726 | 11 | 48256442 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 3.323E-6 | 0.01 | -808449 | gtex_brain_ba24 |
| RS11039637 | 11 | 48306980 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 4.127E-6 | 0.01 | -858987 | gtex_brain_ba24 |
| RS12221998 | 11 | 48308762 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 3.827E-6 | 0.01 | -860769 | gtex_brain_ba24 |
| RS12221999 | 11 | 48308763 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 3.827E-6 | 0.01 | -860770 | gtex_brain_ba24 |
| RS11530190 | 11 | 48309157 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 3.017E-7 | 0.01 | -861164 | gtex_brain_ba24 |
| RS11530193 | 11 | 48309239 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 6.288E-6 | 0.01 | -861246 | gtex_brain_ba24 |
| RS11039644 | 11 | 48314317 | PSMC3 | ENSG00000165916.4 | 4.669E-6 | 0.01 | -866324 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tnfaip8l3 | 0.61 | 0.52 |
| Wnt5a | 0.58 | 0.51 |
| NR3C2 | 0.57 | 0.61 |
| PKP2 | 0.56 | 0.51 |
| Neurod1 | 0.54 | 0.32 |
| NRP1 | 0.54 | 0.46 |
| BNC1 | 0.53 | 0.21 |
| dusp | 0.52 | 0.35 |
| matn2 | 0.52 | 0.60 |
| C1QTNF3 | 0.52 | 0.24 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC098691.2 | -0.24 | -0.28 |
| AF347015.21 | -0.23 | -0.20 |
| MT-CO2 | -0.21 | -0.18 |
| PLA2G5 | -0.21 | -0.15 |
| AF347015.18 | -0.21 | -0.22 |
| AF347015.8 | -0.21 | -0.17 |
| clec2b | -0.19 | -0.17 |
| IL32 | -0.19 | -0.20 |
| mt-cyb | -0.19 | -0.15 |
| AF347015.33 | -0.19 | -0.13 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003713 | 转录共激活因子活性 | 塔斯 | 8419915 | |
| 去：0003714 | 转录CorePressor活性 | 塔斯 | 2194290 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17220478|17353931 | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0017111 | 核苷 - 三磷酸酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001824 | 胚泡发育 | IEA | - | |
| GO：0031145 | 后期促进复合依赖性蛋白酶体依赖性蛋白质分解代谢过程 | 经验 | 11285280 | |
| 去：0030163 | 蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
| GO：0051436 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素蛋白连接酶活性的负调控 | 经验 | 15029244 | |
| GO：0051437 | 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 | 经验 | 12791267 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000502 | 蛋白酶体复合物 | 塔斯 | 8811196 | |
| 去：0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 塔斯 | 2194290 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CDKN2A | arf |cdk4i |CDKN2 |CMM2 |ink4 |ink4a |MLM |MTS1 |TP16 |P14 | p14ARF | p16 | p16INK4 | p16INK4a | p19 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2a（黑色素瘤，p16，抑制CDK4） | P14arf与TBP-1相互作用。 | 绑定 | 14665636 |
| EPAS1 | ecyt4 |hif2a |HLF |mop2 |PASD2 | 内皮PAS域蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14556007 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | - | HPRD，Biogrid | 14556007 |
| htr1e | 5-HT1E | 5-羟色胺（5-羟色胺）受体1E | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PAAF1 | FLJ11848 |PAAF |RPN14 |WDR71 | 蛋白酶体ATPase相关因子1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC3 | MGC8487 |TBP1 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，3 | - | HPRD | 11463857 |
| PSMC3IP | GT198 |Hop2 |humgt198a |TBPIP | PSMC3相互作用蛋白 | - | HPRD | 9345291 |
| PSMC4 | MGC13687 |MGC23214 |MGC8570 |MIP224 |S6 |TBP7 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC4 | MGC13687 |MGC23214 |MGC8570 |MIP224 |S6 |TBP7 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，4 | - | HPRD | 11463857 |
| PSMC5 | S8 |sug1 |TBP10 |Trip1 |P45 |p45/sug | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，5 | - | HPRD，Biogrid | 11463857 |
| PSMD10 | DJ889N15.2 |P28 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，10 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD13 | HSPC027 |rpn9 |S11 |P40.5 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，13 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD6 | KIAA0107 |rpn7 |S10 |SGA-113M |P44S10 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| STX11 | FHL4 |HLH4 |HPLH4 | 语法11 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| traf6 | MGC：3310 |RNF85 | TNF受体相关因子6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 14743216 |
| txnrd2 | 塞尔兹|tr |tr-beta |tr3 |TRXR2 | 硫氧还蛋白还原酶2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 11463857 |
| VHL | HRCA1 |RCA1 |VHL1 | von Hippel-Lindau肿瘤抑制剂 | - | HPRD，Biogrid | 14556007 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg蛋白酶体 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta蛋白酶体途径 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工交叉呈现 | 76 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ER吞噬体途径 | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ORC1从染色质中去除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 | 51 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 | 48 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 凋亡的反应组调节 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome M G1过渡 | 81 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CDT1与CDC6 ORC起源复合物的关联 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂G1 G1 S相 | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 复制前复合物的反应组装 | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome VIF介导的apobec3g降解 | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jazag TGFB1信号传导DN | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 怀特赫斯特紫杉醇敏感性 | 39 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delaserna Myod的目标 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制肌肉 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee衰老的肌肉DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄蛋白酶体基因模块 | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |