基因页面:SLC17A7
总结吗?
| GeneID | 57030年 |
| 象征 | SLC17A7 |
| 同义词 | BNPI | VGLUT1 |
| 描述 | 溶质载体家庭17个成员7 |
| 参考 | MIM: 605208|HGNC: HGNC: 16704|运用:ENSG00000104888|HPRD: 05551|织女:OTTHUMG00000183166 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19个问题 |
| 帕斯卡假定值 | 0.022 |
| 夏洛克假定值 | 0.622 |
| 胎儿β | -2.556 |
| eGene | 元 |
| 支持 | METABOTROPIC谷氨酸受体 神经递质代谢 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:4 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005215 | 运输活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015293 | 同向转运活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015321 | 磷酸sodium-dependent跨膜转运体活动 | 助教 | 8632143 | |
| 去:0015319 | 钠:无机磷酸盐同向转运活动 | 艾达 | 10820226 | |
| 去:0031402 | 钠离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0042137 | 隔绝的神经递质 | 国际能源机构 | 神经递质(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0006836 | 神经递质运输 | 国际能源机构 | 神经元,神经递质(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0006817 | 磷酸运输 | 助教 | 8632143 | |
| 去:0006814 | 钠离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0008021 | 突触囊泡 | 国际能源机构 | Synap,神经递质(术语层面:12) | - - - - - - |
| 去:0019717 | 突触体 | 国际能源机构 | Synap,大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 艾达 | 10820226 | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0031410 | 胞质囊泡 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME谷氨酸神经递质释放周期 | 15 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在化学突触REACTOME传输 | 186年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经递质释放周期 | 34 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SLC介导的跨膜运输 | 241年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME运输无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽 | 94年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME氨基酸、寡肽SLC转运蛋白 | 49 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标12小时 | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯塔克HYPPOCAMPUS 22 q11删除 | 53 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的大脑22 q11删除 | 13 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张EWSR1 FLI1融合的目标 | 88年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑DN | 153年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染24小时血巨细胞病毒 | 148年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近端树突LEIN本地化 | 37 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标了 | 317年 | 208年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化 | 461年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF和H3K27ME3连结控制协定 | 70年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACOSTA扩散独立MYC目标 | 84年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MIYAGAWA EWSR1 ETS的目标融合起来 | 259年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-125/351 | 892年 | 898年 | m8 | hsa - mir - 125 b大脑 | UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA |
| hsa - mir - 125 a大脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
| mir - 138 | 519年 | 525年 | m8 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
| hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC | ||||
| mir - 142 - 5 - p | 832年 | 838年 | m8 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 830年 | 837年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| miR-204/211 | 995年 | 1002年 | 1、m8 | hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU |
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| mir - 539 | 866年 | 872年 | 1 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |