基因页面:TWSG1
总结吗?
| GeneID | 57045年 |
| 象征 | TWSG1 |
| 同义词 | 次数 |
| 描述 | 扭曲的原肠胚形成BMP信号调制器1 |
| 参考 | MIM: 605049|HGNC: HGNC: 12429|运用:ENSG00000128791|HPRD: 05443|织女:OTTHUMG00000131597 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 18 p11.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.002 |
| 夏洛克假定值 | 0.277 |
| eGene | 尾状基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs8093378 | 18 | 9336740 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 2.175 e - | 0 | 1975年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8093683 | 18 | 9336979 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 2.162 e - | 0 | 2214年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62087465 | 18 | 9339057 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 2.046 e - | 0 | 4292年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12457923 | 18 | 9339571 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 2.019 e - | 0 | 4806年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs73399928 | 18 | 9341347 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.92 e - | 0 | 6582年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12458365 | 18 | 9341733 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.9 e - | 0 | 6968年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs201444092 | 18 | 9341806 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.898 e - | 0 | 7041年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56396800 | 18 | 9341807 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.896 e - | 0 | 7042年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12456325 | 18 | 9342066 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.885 e - | 0 | 7301年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62087466 | 18 | 9343987 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.804 e - | 0 | 9222年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs57333366 | 18 | 9344737 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.772 e - | 0 | 9972年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs113641426 | 18 | 9351874 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.619 e - | 0 | 17109年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62087468 | 18 | 9352071 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.619 e - | 0 | 17306年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16954989 | 18 | 9353809 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 19044年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16954996 | 18 | 9357199 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 22434年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11875065 | 18 | 9357749 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 22984年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8088103 | 18 | 9365590 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.488 e - | 0 | 30825年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56349417 | 18 | 9371163 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 36398年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7243117 | 18 | 9381229 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 3.964 e-8 | 0 | 46464年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34741369 | 18 | 9382477 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 47712年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9676006 | 18 | 9386121 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 2.626 e - | 0 | 51356年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs139460418 | 18 | 9386312 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 51547年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs57456386 | 18 | 9390346 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.592 e - | 0 | 55581年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9748497 | 18 | 9396995 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.464 e - | 0 | 62230年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs62087494 | 18 | 9397004 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.579 e - | 0 | 62239年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9748605 | 18 | 9397015 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.474 e - | 0 | 62250年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7229150 | 18 | 9397172 | TWSG1 | ENSG00000128791.7 | 1.131 e-6 | 0 | 62407年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0030900 | 前脑发展 | 国际能源机构 | 大脑(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0001503 | 骨化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0001707 | 中胚层的形成 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009790 | 胚胎发育 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009888 | 组织发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030513 | 积极的监管BMP信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030514 | - BMP信号通路的调控 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043010 | camera-type眼发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030097 | 造血作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045668 | 负调节成骨细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005615 | 细胞外空间 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 森古普塔鼻咽癌起来 | 294年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 | 329年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 女王的目标PAX3 FOXO1融合起来 | 60 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗斯AML AML1 ETO融合 | 76年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群P4 | One hundred. | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 藤井裕久YBX1 DN的目标 | 202年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布卢姆应对SALIRASIB DN | 342年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A6差 | 456年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性DN | 457年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN KARLSSON TGFB1目标 | 207年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 439年 | 445年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||