概括
基因 57085
象征 Agtrap
同义词 陷阱
描述 血管紧张素II受体相关蛋白
参考 MIM:608729|HGNC:HGNC:13539|ENSEMBL:ENSG00000177674|HPRD:16379|Vega:Otthumg00000002230
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.22
Pascal P值 0.103
Sherlock P值 0.064
胎儿β -0.378
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11080561 CHR18 12257229 Agtrap 57085 0.09 反式
RS17719234 CHR19 11498213 Agtrap 57085 0.15 反式
RS10126993 Chrx 35885796 Agtrap 57085 0.01 反式
RS6629018 Chrx 35932709 Agtrap 57085 0.02 反式
RS6527524 0 Agtrap 57085 0 反式
RS4501739 Chrx 35960848 Agtrap 57085 9.87e-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gottwein的KSHV Mir K12 11 63 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL顺式 65 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧癌 83 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS脂肪细胞分化DN 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因