基因页面:PCNP
总结吗?
| GeneID | 57092年 |
| 象征 | PCNP |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 害虫蛋白水解含有核内蛋白的信号 |
| 参考 | MIM: 615210|HGNC: HGNC: 30023|运用:ENSG00000081154|HPRD: 17826|织女:OTTHUMG00000159108 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q12.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.716 |
| 胎儿β | 1.014 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04359 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.04047 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg05253057 | 3 | 101293208 | PCNP | 4.02 e-8 | -0.01 | 1.13 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 12176013 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007049 | 细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016567 | 蛋白质泛素化 | 艾达 | 14741369 | |
| 去:0043161 | 蛋白酶体ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 | 艾达 | 14741369 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 12176013 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性DN | 210年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 前川ATF2目标 | 24 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 181 | 701年 | 707年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 200 bc / 429 | 693年 | 699年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| mir - 218 | 1063年 | 1069年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| mir - 365 | 502年 | 508年 | m8 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
| mir - 410 | 176年 | 182年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 421 | 763年 | 769年 | 1 | hsa - mir - 421 | GGCCUCAUUAAAUGUUUGUUG |
| mir - 431 | 190年 | 196年 | 1 | hsa - mir - 431 | UGUCUUGCAGGCCGUCAUGCA |
| miR-9 | 681年 | 687年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |