基因页:PDSS2
概括?
基因 | 57107 |
象征 | PDSS2 |
同义词 | c6orf210 | coq10d3 | dlp1 | ba59i9.3 | hdlp1 |
描述 | 前(脱磷酸)双磷酸合酶,亚基2 |
参考 | MIM:610564|HGNC:HGNC:23041|ENSEMBL:ENSG00000164494|HPRD:12879|Vega:Otthumg0000000059359 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q21 |
Pascal P值 | 0.397 |
Sherlock P值 | 0.003 |
胎儿β | -0.027 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDSS2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000010 | 跨 - 脱酰肾上腺转移酶活性 | 艾达 | 16262699 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | 艾达 | 16262699 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006744 | 泛酮生物合成过程 | 艾达 | 16262699 | |
去:0008299 | 异普尼生物合成过程 | 艾达 | 16262699 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg萜类骨干生物合成 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-203.1 | 1010 | 1017 | 1A,M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-488 | 1410 | 1417 | 1A,M8 | HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa |