基因页：SLC44A2

总结？
GeneID 57153
象征 SLC44A2
同义词 CTL2 | PP1292
描述 Solute Carrier家族44会员2
参考 MIM：606106|HGNC：HGNC：17292|ENSEMBL：ENSG00000129353|HPRD：16198|Vega：Otthumg00000180585
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.1
Pascal P值 0.63
Sherlock P值 0.506
胎儿β -0.094
DMG 2（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG21631439 19 10736448 SLC44A2 3.631E-4 -0.487 0.042 DMG：Wockner_2014
CG01247891 19 10713543 SLC44A2 4.37E-9 -0.012 2.6e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0015220 胆碱跨膜转运蛋白活性 塔斯 神经递质（GO期限：6） 10677542
去：0004871 信号传感器活性 小鬼 12761501
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015871 胆碱运输 塔斯 神经递质（GO期限：6） 10677542
去：0006810 运输 IEA -
GO：0043123 I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 小鬼 12761501
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005813 中心体 艾达 18029348
去：0005856 细胞骨架 艾达 18029348
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 塔斯 10677542
GO：0043231 细胞内膜结合的细胞器 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome合成 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胺化合物SLC转运蛋白 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郑对砷DN的反应 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 568 574 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-182 918 925 1A，M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-34/449 99 105 M8 HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir - 96 919 925 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc