基因页:PELI2
概括?
基因 | 57161 |
象征 | PELI2 |
同义词 | - |
描述 | Pellino E3泛素蛋白连接酶家族成员2 |
参考 | MIM:614798|HGNC:HGNC:8828|Ensembl:ENSG00000139946|HPRD:17835|Vega:Otthumg00000152336 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q21 |
Pascal P值 | 0.011 |
Sherlock P值 | 0.385 |
胎儿β | 2.554 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04368094 | 14 | 56586522 | PELI2 | 5.462E-4 | -0.392 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
CG21099488 | 14 | 56585486 | PELI2 | -0.027 | 0.29 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PELI2 | 57161 | 2.968E-6 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | PELI2 | 57161 | 0.01 | 反式 | ||
RS17058970 | CHR3 | 58191241 | PELI2 | 57161 | 0.06 | 反式 | ||
RS10498433 | CHR14 | 52289530 | PELI2 | 57161 | 0.17 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PELI2 | 57161 | 5.647E-5 | 反式 | ||
RS2908972 | CHR17 | 11407258 | PELI2 | 57161 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL1信号传导 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Irak1招募IKK综合体 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发和癌症Box5 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
丁格被迪切尔沉默 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshioka肝癌早期复发 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |