基因页：PSMD13
概括？
| 基因 | 5719 |
| 象征 | PSMD13 |
| Synonyms | HSPC027 | RPN9 | S11 | P40.5 |
| Description | 蛋白酶体26S亚基，非ATPase 13 |
| Reference | MIM:603481|HGNC：HGNC：9558|ENSEMBL：ENSG00000185627|HPRD：04595|Vega:OTTHUMG00000119072 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P15.5 |
| Pascal P值 | 0.967 |
| Sherlock P值 | 0.817 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009：CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.18：CC_BA10_DISEASE_P = 0.0054：HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.21：HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0116 |
| 胎儿β | 0.697 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 Putamen basal ganglia 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| DEG：Maycox_2009 | Microarray to determine the expression of over 30000 mRNA transcripts in post-mortem tissue | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7116130 | Chr11 | 244128 | PSMD13 | 5719 | 0.12 | 顺式 | ||
| RS1128322 | Chr11 | 244196 | PSMD13 | 5719 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS532483 | Chr11 | 257029 | PSMD13 | 5719 | 0.18 | 顺式 | ||
| RS17156153 | Chr11 | 270513 | PSMD13 | 5719 | 0.13 | 顺式 | ||
| RS6751123 | CHR2 | 62749568 | PSMD13 | 5719 | 0.04 | 反式 | ||
| RS56232710 | 11 | 202072 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.208e-11 | 0 | -36926 | gtex_brain_ba24 |
| RS1045454 | 11 | 204228 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | -34770 | gtex_brain_ba24 |
| RS56357554 | 11 | 204715 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.892e-11 | 0 | -34283 | gtex_brain_ba24 |
| RS3782120 | 11 | 206089 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | -32909 | gtex_brain_ba24 |
| rs7930823 | 11 | 206767 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.294E-6 | 0 | -32231 | gtex_brain_ba24 |
| RS143657869 | 11 | 207254 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.119e-11 | 0 | -31744 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598075 | 11 | 207275 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.479E-9 | 0 | -31723 | gtex_brain_ba24 |
| RS58692051 | 11 | 207410 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.513E-9 | 0 | -31588 | gtex_brain_ba24 |
| RS201633036 | 11 | 209893 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.231E-7 | 0 | -29105 | gtex_brain_ba24 |
| RS3832797 | 11 | 209894 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 7.778e-8 | 0 | -29104 | gtex_brain_ba24 |
| RS200040945 | 11 | 209898 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.115E-7 | 0 | -29100 | gtex_brain_ba24 |
| rs2293167 | 11 | 211644 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | -27354 | gtex_brain_ba24 |
| RS76552490 | 11 | 212015 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | -26983 | gtex_brain_ba24 |
| RS12574034 | 11 | 212262 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.263e-12 | 0 | -26736 | gtex_brain_ba24 |
| RS1533825 | 11 | 214163 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | -24835 | gtex_brain_ba24 |
| RS1533824 | 11 | 214169 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 7.618e-7 | 0 | -24829 | gtex_brain_ba24 |
| RS3825075 | 11 | 217140 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.401E-12 | 0 | -21858 | gtex_brain_ba24 |
| rs511744 | 11 | 219089 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.884e-12 | 0 | -19909 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598074 | 11 | 219398 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.346E-11 | 0 | -19600 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598073 | 11 | 219452 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.238E-6 | 0 | -19546 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598072 | 11 | 219793 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.552e-11 | 0 | -19205 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598071 | 11 | 219800 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.553e-11 | 0 | -19198 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902107 | 11 | 220315 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.102e-11 | 0 | -18683 | gtex_brain_ba24 |
| rs10794301 | 11 | 220401 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.975e-11 | 0 | -18597 | gtex_brain_ba24 |
| RS6421986 | 11 | 221659 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 5.346e-11 | 0 | -17339 | gtex_brain_ba24 |
| RS3782118 | 11 | 222620 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.617E-9 | 0 | -16378 | gtex_brain_ba24 |
| RS3782116 | 11 | 223119 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.573E-8 | 0 | -15879 | gtex_brain_ba24 |
| RS3782115 | 11 | 223272 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.411E-7 | 0 | -15726 | gtex_brain_ba24 |
| RS7943246 | 11 | 225171 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.465e-11 | 0 | -13827 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598070 | 11 | 225466 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.429e-11 | 0 | -13532 | gtex_brain_ba24 |
| RS7104764 | 11 | 229977 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.452e-11 | 0 | -9021 | gtex_brain_ba24 |
| RS3829998 | 11 | 230751 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.461E-11 | 0 | -8247 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902109 | 11 | 230862 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.463e-11 | 0 | -8136 | gtex_brain_ba24 |
| RS7483951 | 11 | 231758 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.472e-11 | 0 | -7240 | gtex_brain_ba24 |
| rs10794302 | 11 | 234102 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.147e-12 | 0 | -4896 | gtex_brain_ba24 |
| rs9795476 | 11 | 235894 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.51e-11 | 0 | -3104 | gtex_brain_ba24 |
| RS11246029 | 11 | 236473 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.243e-11 | 0 | -2525 | gtex_brain_ba24 |
| RS519592 | 11 | 236811 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.51e-12 | 0 | -2187 | gtex_brain_ba24 |
| RS2272563 | 11 | 236871 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.575e-11 | 0 | -2127 | gtex_brain_ba24 |
| RS1045288 | 11 | 237087 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.058e-11 | 0 | -1911 | gtex_brain_ba24 |
| RS3817629 | 11 | 237312 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | -1686 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902110 | 11 | 237648 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | -1350 | gtex_brain_ba24 |
| RS7481993 | 11 | 237875 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | -1123 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598069 | 11 | 240664 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.729e-11 | 0 | 1666 | gtex_brain_ba24 |
| RS7481518 | 11 | 240867 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.176E-13 | 0 | 1869 | gtex_brain_ba24 |
| RS7482209 | 11 | 240868 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 5.497E-13 | 0 | 1870 | gtex_brain_ba24 |
| RS7395328 | 11 | 242624 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 3626 | gtex_brain_ba24 |
| rs67547655 | 11 | 243017 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 7.396E-13 | 0 | 4019 | gtex_brain_ba24 |
| RS59225278 | 11 | 243020 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 7.537e-12 | 0 | 4022 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598068 | 11 | 243092 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.36e-11 | 0 | 4094 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598067 | 11 | 243093 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.084e-11 | 0 | 4095 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598066 | 11 | 243185 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.247e-11 | 0 | 4187 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598065 | 11 | 243211 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4213 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598064 | 11 | 243557 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4559 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598063 | 11 | 243672 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4674 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598062 | 11 | 243712 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4714 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598061 | 11 | 243853 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4855 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598060 | 11 | 243987 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 4989 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902112 | 11 | 244106 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5108 | gtex_brain_ba24 |
| RS7107362 | 11 | 244108 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5110 | gtex_brain_ba24 |
| RS7128044 | 11 | 244115 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5117 | gtex_brain_ba24 |
| RS7116130 | 11 | 244129 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.168E-11 | 0 | 5131 | gtex_brain_ba24 |
| RS7128029 | 11 | 244141 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.031e-11 | 0 | 5143 | gtex_brain_ba24 |
| RS1128320 | 11 | 244167 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5169 | gtex_brain_ba24 |
| RS1128321 | 11 | 244171 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5173 | gtex_brain_ba24 |
| RS1128322 | 11 | 244197 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5199 | gtex_brain_ba24 |
| RS2272565 | 11 | 244414 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.52e-11 | 0 | 5416 | gtex_brain_ba24 |
| RS398054895 | 11 | 244490 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.425e-11 | 0 | 5492 | gtex_brain_ba24 |
| RS6598059 | 11 | 244961 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.077E-10 | 0 | 5963 | gtex_brain_ba24 |
| RS7124022 | 11 | 244964 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.094E-10 | 0 | 5966 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902113 | 11 | 245523 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.529e-11 | 0 | 6525 | gtex_brain_ba24 |
| rs78942883 | 11 | 245783 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.651E-11 | 0 | 6785 | gtex_brain_ba24 |
| rs7482591 | 11 | 245861 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.698e-11 | 0 | 6863 | gtex_brain_ba24 |
| RS10902114 | 11 | 246234 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.666e-11 | 0 | 7236 | gtex_brain_ba24 |
| rs10794304 | 11 | 246456 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.727e-11 | 0 | 7458 | gtex_brain_ba24 |
| RS10400248 | 11 | 247029 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.087E-11 | 0 | 8031 | gtex_brain_ba24 |
| RS3830001 | 11 | 247200 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.934E-6 | 0 | 8202 | gtex_brain_ba24 |
| RS56232710 | 11 | 202072 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.934E-11 | 0 | -36926 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1045454 | 11 | 204228 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.35e-11 | 0 | -34770 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56357554 | 11 | 204715 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.87e-11 | 0 | -34283 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3782120 | 11 | 206089 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 5.144e-12 | 0 | -32909 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7930823 | 11 | 206767 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.313E-6 | 0 | -32231 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS143657869 | 11 | 207254 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.118e-11 | 0 | -31744 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598075 | 11 | 207275 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.347E-9 | 0 | -31723 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS58692051 | 11 | 207410 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.412E-9 | 0 | -31588 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201633036 | 11 | 209893 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 9.837E-8 | 0 | -29105 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3832797 | 11 | 209894 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.421E-8 | 0 | -29104 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200040945 | 11 | 209898 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.291E-9 | 0 | -29100 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2293167 | 11 | 211644 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.724E-12 | 0 | -27354 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS76552490 | 11 | 212015 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.724E-12 | 0 | -26983 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12574034 | 11 | 212262 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.743e-12 | 0 | -26736 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1533825 | 11 | 214163 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.724E-12 | 0 | -24835 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1533824 | 11 | 214169 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.252E-11 | 0 | -24829 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3825075 | 11 | 217140 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.304E-13 | 0 | -21858 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs511744 | 11 | 219089 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 5.842E-12 | 0 | -19909 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598074 | 11 | 219398 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.733E-11 | 0 | -19600 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598073 | 11 | 219452 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.114e-7 | 0 | -19546 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598072 | 11 | 219793 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.016e-12 | 0 | -19205 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598071 | 11 | 219800 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.015e-12 | 0 | -19198 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902107 | 11 | 220315 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.935e-12 | 0 | -18683 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10794301 | 11 | 220401 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.677E-12 | 0 | -18597 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6421986 | 11 | 221659 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 9.237E-12 | 0 | -17339 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3782118 | 11 | 222620 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.097E-9 | 0 | -16378 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3782116 | 11 | 223119 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.11E-8 | 0 | -15879 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3782115 | 11 | 223272 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 5.41E-9 | 0 | -15726 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7943246 | 11 | 225171 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.555e-12 | 0 | -13827 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598070 | 11 | 225466 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.541e-11 | 0 | -13532 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7104764 | 11 | 229977 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.108e-12 | 0 | -9021 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3829998 | 11 | 230751 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.11E-12 | 0 | -8247 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902109 | 11 | 230862 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.11E-12 | 0 | -8136 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7483951 | 11 | 231758 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.112e-12 | 0 | -7240 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10794302 | 11 | 234102 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.102E-12 | 0 | -4896 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9795476 | 11 | 235894 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.117e-12 | 0 | -3104 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11246029 | 11 | 236473 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.652e-12 | 0 | -2525 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS519592 | 11 | 236811 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.682e-11 | 0 | -2187 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2272563 | 11 | 236871 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.124e-12 | 0 | -2127 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1045288 | 11 | 237087 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.355e-12 | 0 | -1911 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3817629 | 11 | 237312 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | -1686 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902110 | 11 | 237648 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | -1350 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7481993 | 11 | 237875 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | -1123 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598069 | 11 | 240664 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.11E-12 | 0 | 1666 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7481518 | 11 | 240867 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.82e-14 | 0 | 1869 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7482209 | 11 | 240868 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 3.688E-14 | 0 | 1870 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7395328 | 11 | 242624 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 3626 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67547655 | 11 | 243017 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.842E-13 | 0 | 4019 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS59225278 | 11 | 243020 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.092e-11 | 0 | 4022 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598068 | 11 | 243092 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 4.601E-14 | 0 | 4094 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598067 | 11 | 243093 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.311E-14 | 0 | 4095 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598066 | 11 | 243185 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.716e-11 | 0 | 4187 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598065 | 11 | 243211 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4213 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598064 | 11 | 243557 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4559 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598063 | 11 | 243672 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4674 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598062 | 11 | 243712 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4714 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598061 | 11 | 243853 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4855 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598060 | 11 | 243987 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 4989 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902112 | 11 | 244106 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5108 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7107362 | 11 | 244108 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5110 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7128044 | 11 | 244115 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5117 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7116130 | 11 | 244129 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.546e-12 | 0 | 5131 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7128029 | 11 | 244141 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.38e-12 | 0 | 5143 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1128320 | 11 | 244167 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5169 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1128321 | 11 | 244171 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5173 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1128322 | 11 | 244197 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5199 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2272565 | 11 | 244414 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.118e-12 | 0 | 5416 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS398054895 | 11 | 244490 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 7.617E-13 | 0 | 5492 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2272566 | 11 | 244552 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.516E-6 | 0 | 5554 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598059 | 11 | 244961 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.09e-11 | 0 | 5963 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7124022 | 11 | 244964 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.743e-12 | 0 | 5966 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902113 | 11 | 245523 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.125e-12 | 0 | 6525 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78942883 | 11 | 245783 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.305e-12 | 0 | 6785 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7482591 | 11 | 245861 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.266e-12 | 0 | 6863 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10902114 | 11 | 246234 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.363e-12 | 0 | 7236 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10794304 | 11 | 246456 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.415e-12 | 0 | 7458 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10400248 | 11 | 247029 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.492e-12 | 0 | 8031 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3830001 | 11 | 247200 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.475E-6 | 0 | 8202 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598056 | 11 | 252283 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.373E-7 | 0 | 13285 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7930624 | 11 | 253841 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.601E-7 | 0 | 14843 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6598054 | 11 | 254010 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 8.601E-7 | 0 | 15012 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7121085 | 11 | 258523 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.355E-6 | 0 | 19525年 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7111364 | 11 | 258542 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.355E-6 | 0 | 19544年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7950638 | 11 | 259695 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.389E-6 | 0 | 20697 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS367850937 | 11 | 273615 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.32E-6 | 0 | 34617 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35409720 | 11 | 277365 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 1.424E-6 | 0 | 38367 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS200516324 | 11 | 277424 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.73E-6 | 0 | 38426 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71487220 | 11 | 277425 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 2.688E-6 | 0 | 38427 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS79248624 | 11 | 278126 | PSMD13 | ENSG00000185627.13 | 6.879E-7 | 0 | 39128 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CRB1 | LCA8 |RP12 | 碎屑同源1（果蝇） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| FES | FPS | 猫科动物肉瘤 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| mthfd2 | NMDMC | 甲基苯二甲酸叶酸脱氢酶（NADP+依赖性）2，甲苯基四氢叶酸环丙醇酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMA1 | HC2 |MGC14542 |MGC14575 |MGC14751 |MGC1667 |MGC21459 |MGC22853 |MGC23915 |nu |PROS30 | 蛋白酶体（Prosome，宏观）亚基，Alpha型，1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMA3 | HC8 |MGC12306 |MGC32631 |PSC3 | 蛋白酶体（Prosome，大型）亚基，α类型，3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMA6 | iota |MGC22756 |MGC2333 |MGC23846 |Pros27 |P27K | 蛋白酶体（Prosome，大型）亚基，α类型，6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMA7 | C6 |HSPC |MGC3755 |RC6-1 |XAPC7 | 蛋白酶体（Prosome，宏观）亚基，α类型，7 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC1 | MGC24583 |MGC8541 |P26S4 |S4 |p56 | 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,atpae, 1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC2 | MGC3004 |MSS1 |NBLA10058 |S7 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC3 | MGC8487 |TBP1 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC4 | MGC13687 |MGC23214 |MGC8570 |MIP224 |S6 |TBP7 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC5 | S8 |sug1 |TBP10 |Trip1 |P45 |p45/sug | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，5 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMC6 | CADP44 |MGC12520 |P44 |sug2 |P42 | 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,atpae, 6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD1 | MGC133040 |MGC133041 |P112 |rpn2 |S1 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD11 | MGC3844 |rpn6 |S9 |P44.5 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，11 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD12 | MGC75406 |rpn5 |p55 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，12 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD14 | pad1 |poh1 |RPN11 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，14 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD2 | MGC14274 | P97 | Rpn1 | S2 | TRAP2 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD3 | P58 |rpn3 |S3 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD4 | AF |AF-1 |ASF |MCB1 |RPN10 |S5A |PUB-R5 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD6 | KIAA0107 |rpn7 |S10 |SGA-113M |P44S10 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD7 | mov34 |P40 |rpn8 |S12 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，7 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PSMD8 | hip6 |hypf |MGC1660 |nin1p |RPN12 |S14 |p31 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，8 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| SLC25A22 | FLJ13044 |GC1 | 溶质载体家族25（线粒体载体：谷氨酸），成员22 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| traf6 | MGC:3310 | RNF85 | TNF receptor-associated factor 6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 14743216 |
| VHL | HRCA1 | RCA1 | VHL1 | von Hippel-Lindau肿瘤抑制剂 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | # SZGR 2.0 genes in pathway | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg蛋白酶体 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY WNT | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 可溶性外源抗原内体的反应组交叉表现 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工交叉呈现 | 76 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ER吞噬体途径 | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ORC1从染色质中去除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P53独立G1 S DNA损伤检查点 | 51 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组CDK介导的磷酸化和CDC6的去除 | 48 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME REGULATION OF APOPTOSIS | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P53依赖G1 DNA损伤响应 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome M G1过渡 | 81 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CDT1 ASSOCIATION WITH THE CDC6 ORC ORIGIN COMPLEX | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| E3泛素连接酶COP1的Reactome自动降解 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂G1 G1 S相 | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME REGULATION OF MITOTIC CELL CYCLE | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 复制前复合物的反应组装 | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AUF1 HNRNP D0对mRNA的反应组不稳定 | 53 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME APOPTOSIS | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDH1介导的CDC20和其他APC C CDH1靶向蛋白质的降解早期G1早期 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome APC C CDC20介导的有丝分裂蛋白降解 | 73 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CDH1 APC C对CDH1的反应组自动降解 | 64 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome VIF介导的apobec3g降解 | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应20 MCF10A | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION UP | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOFMANN MYELODYSPLASTIC SYNDROM LOW RISK DN | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |