概括
基因 57209
象征 ZNF248
同义词 BA162G10.3
描述 锌指蛋白248
参考 HGNC:HGNC:13041|ENSEMBL:ENSG00000198105|HPRD:15757|Vega:Otthumg0000000017980
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p11.2
Pascal P值 0.596
Sherlock P值 0.347
胎儿β 1.019
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG16974379 10 38146505 ZNF248 3.75e-9 -0.01 2.38e-6 DMG:JAFFE_2016
CG04308323 10 38146959 ZNF248 4.12E-9 -0.02 2.5e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号传导DN 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 2小时DN的响应 55 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因