基因页:PTEN
概括?
GeneID | 5728 |
象征 | PTEN |
同义词 | 10q23del | bzs | cws1 | dec | glm2 | mham | mmac1 | pten1 | tep1 |
描述 | phosphatase and tensin homolog |
参考 | MIM:601728|HGNC:HGNC:9588|Ensembl:ENSG00000171862|HPRD:03431|Vega:Otthumg0000000018688 |
基因类型 | protein-coding |
地图位置 | 10q23.3 |
Pascal P值 | 0.023 |
Sherlock P值 | 0.599 |
Fetal beta | 0.974 |
eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP targets |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击to show details |
GO_Annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0628 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Differentially methylated gene
探测 | 染色体 | 位置 | Nearest gene | P (dis) | beta(dis) | FDR (dis) | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18141918 | 10 | 89622539 | pten;基林 | 1.68e-5 | -0.479 | 0.015 | DMG:Wockner_2014 |
cg09472211 | 10 | 89622126 | pten;基林 | 1.747E-4 | -0.214 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
eQTL annotation
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16856298 | CHR2 | 131650534 | PTEN | 5728 | 0.17 | 反式 | ||
RS6759753 | CHR2 | 131654455 | PTEN | 5728 | 0.12 | 反式 |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTEN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0005515 | protein binding | IPI | 15951562|17218262|17274640 |18064632 |
|
去:0004725 | protein tyrosine phosphatase activity | IDA | 9256433 | |
去:0004722 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性 | IDA | 9256433 | |
GO:0004438 | phosphatidylinositol-3-phosphatase activity | IDA | 9811831 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
去:0030165 | PDZ domain binding | IPI | 10646847|10760291 | |
去:0008138 | protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity | IEA | - | |
GO:0016314 | 磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸3-磷酸酶活性 | 经验 | 9593664 | |
GO:0016314 | 磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸3-磷酸酶活性 | IDA | 9593664|9811831 | |
GO:0051717 | inositol-1,3,4,5-tetrakisphosphate 3-phosphatase activity | IDA | 9593664 | |
GO:0051800 | 磷脂酰肌醇-3,4-双磷酸3-磷酸酶活性 | IDA | 9811831 | |
Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0007417 | 中枢神经系统发展 | ISS | 大脑(GO期限:6) | - |
GO:0000079 | regulation of cyclin-dependent protein kinase activity | 塔斯 | 10918569 | |
去:0001525 | angiogenesis | IEA | - | |
GO:0006470 | protein amino acid dephosphorylation | IDA | 9256433 | |
GO:0006470 | protein amino acid dephosphorylation | 塔斯 | 9367992 | |
去:0006917 | induction of apoptosis | ISS | - | |
去:0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | 小鬼 | 10468583 | |
GO:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
去:0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
GO:0048738 | 心肌发育 | IEA | - | |
GO:0030336 | 细胞迁移的负调节 | 小鬼 | 9616126 | |
GO:0031647 | 蛋白质稳定性调节 | 小鬼 | 10866658 | |
GO:0046855 | 肌醇磷酸盐去磷酸化 | IDA | 9593664 | |
GO:0046856 | 磷酸肌醇去磷酸化 | IDA | 9593664|9811831 | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
GO:0043542 | 内皮细胞迁移 | IEA | - | |
GO:0051895 | 局灶性形成的负调控 | 小鬼 | 9616126 | |
GO:0051898 | 蛋白激酶B信号级联的负调控 | 小鬼 | 10760291 | |
细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 9593664 | |
GO:0005737 | 细胞质 | IDA | 9187108 | |
GO:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 9367992 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ang | ALS9 |HEL168 |MGC22466 |MGC71966 |rnase4 |RNase5 | 血管生成蛋白,核糖核酸酶,rNase a家族,5 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
AR | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | androgen receptor | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 15205473 |
CAV1 | CAV | MSTP085 | VIP21 | caveolin 1, caveolae protein, 22kDa | - | HPRD,Biogrid | 12176037 |
CAV1 | CAV | MSTP085 | VIP21 | caveolin 1, caveolae protein, 22kDa | caveolin-1 interacts with PTEN. | 绑定 | 12176037 |
chgb | SCG1 | Chromogranin B(秘密素1) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
COPS6 | CSN6 | MOV34-34KD | COP9本构型显微类同源物亚基6(拟南芥) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
CSNK2A1 | CK2A1 |CKII | casein kinase 2, alpha 1 polypeptide | - | HPRD,Biogrid | 12297295 |
CSNK2A2 | CK2A2 |CSNK2A1 |FLJ43934 | 酪蛋白激酶2,α素多肽 | Biochemical Activity Reconstituted Complex |
BioGRID | 12297295 |
ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 15205473 |
GLTSCR2 | Pict-1 |Pict1 | 神经瘤肿瘤抑制候选区域基因2 | PTEN与PICT-1互动。 | 绑定 | 15355975 |
HBA1 | CD31 | MGC126895 | MGC126897 | hemoglobin, alpha 1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
magi2 | acvrip1 |AIP1 |arip1 |magi-2 |SSCAM | membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 2 | - | HPRD | 10760291 |
Magi3 | magi-3 |MGC163281 |RP4-730K3.1 |DJ730K3.2 | membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 | - | HPRD,Biogrid | 10748157 |
Magi3 | magi-3 |MGC163281 |RP4-730K3.1 |DJ730K3.2 | membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 | MAGI3与PTEN/MMAC相互作用。 | 绑定 | 10748157 |
MVP | LRP |VAULT1 | major vault protein | - | HPRD,Biogrid | 12177006 |
PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 10400703 |
PXN | FLJ16691 | 帕西林 | - | HPRD,Biogrid | 11857088 |
ROCK1 | MGC131603 |MGC43611 |P160ROCK |Pro0435 | Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1 | Pten与Rock1相互作用。 | 绑定 | 15793569 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD,Biogrid | 12620407 |
ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I(UBC9同源物,酵母) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12620973 |
UBE2L3 | E2-F1 |l-ubc |ubch7 |UBCM4 | ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 | - | HPRD,Biogrid | 12620973 |
UTP14A | KIAA0266 |NY-CO-16 |SDCCAG16 |DJ537K23.3 | UTP14, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog A (yeast) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG P53 SIGNALING PATHWAY | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG FOCAL ADHESION | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG GLIOMA | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PROSTATE CANCER | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg黑色素瘤 | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG SMALL CELL LUNG CANCER | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA CTCF PATHWAY | 23 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta mtor途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Pten途径 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta EIF4途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta遇到了途径 | 37 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IGF1MTOR途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG PIP3在心脏肌周期中发出信号 | 67 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG趋化性 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST INTEGRIN SIGNALING PATHWAY | 82 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG INSULIN RECEPTOR PATHWAY IN CARDIAC MYOCYTES | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SA PTEN途径 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST PHOSPHOINOSITIDE 3 KINASE PATHWAY | 37 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID BCR 5 Pathway | 65 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid rhoa途径 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3KCI途径 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB PATHWAY | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID套件途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY SCF KIT | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4信号中的Reactome PI3K事件 | 38 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PI3K EVENTS IN ERBB2 SIGNALING | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NGF SIGNALLING VIA TRKA FROM THE PLASMA MEMBRANE | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PHOSPHOLIPID METABOLISM | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
质膜上的PIP的反应组合成 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi代谢 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NEGATIVE REGULATION OF THE PI3K AKT NETWORK | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K AKT激活 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME TCR SIGNALING | 54 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游TCR信号传导 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GAB1信号体 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PI 3K CASCADE | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PIP3 ACTIVATES AKT SIGNALING | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY FGFR | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hwang前列腺癌标记 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roversi Glioma副本编号DN | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MET的Seiden肿瘤发生 | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOWLIN PUBERTAL MAMMARY GLAND | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CORTOIS衰老触发器 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇7 | 27 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LANDEMAINE LUNG METASTASIS | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GUO HEX TARGETS UP | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
亚伯拉罕ALPC与多发性骨髓瘤DN | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAZAERI BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 DN | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 24HR DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DELASERNA MYOD TARGETS DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
敏锐的回应罗格列酮DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN MELANOMA COPY NUMBER DN | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戴尔基癌俯卧反应BPA | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EHLERS ANEUPLOIDY UP | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PALOMERO GSI SENSITIVITY UP | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA胶质母细胞瘤突变 | 8 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng正常老化DN | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KYNG WERNER SYNDROM DN | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇3的时间反应3 | 15 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PILON KLF1 TARGETS DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRUINS UVC RESPONSE LATE | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PURBEY CTBP1的目标SATB1 UP | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR start | UTR end | Match method | |||
mir-130/301 | 2253 | 2259 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
hsa-miR-130b脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
miR-132/212 | 1246 | 1252 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
hsa-miR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc | ||||
hsa-miR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc | ||||
hsa-miR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
miR-141/200a | 1467 | 1473 | M8 | hsa-miR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
hsa-miR-141 | uaacacugucugugugugugaugg | ||||
HSA-MIR-200A | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
mir-144 | 2917 | 2923 | M8 | hsa-miR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
miR-148/152 | 2254 | 2260 | M8 | HSA-MIR-148A | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
hsa-miR-152脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 272 | 278 | M8 | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
hsa-miR-519d | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-181 | 2310 | 2316 | M8 | hsa-miR-181a脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
hsa-miR-181bSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
hsa-miR-181c脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
hsa-miR-181d脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-186 | 2743 | 2749 | M8 | hsa-miR-186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
hsa-miR-186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU | ||||
mir-188 | 762 | 769 | 1A,M8 | hsa-miR-188 | cucccuugcaugguggggu |
hsa-miR-188 | cucccuugcaugguggggu | ||||
mir-19 | 1221 | 1228 | 1A,M8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
hsa-miR-19b | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
mir-193 | 932 | 938 | M8 | HSA-MIR-193A | Aacuggccuacaaagucccag |
HSA-MIR-193B | aacuggcccucaaagucccgcuuu | ||||
MiR-200BC/429 | 2516 | 2522 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-216 | 1105 | 1111 | M8 | HSA-MIR-216 | uaaucucagcuggcaacugug |
mir-217 | 1330 | 1336 | 1a | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
mir-22 | 689 | 696 | 1A,M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-23 | 1608 | 1615年 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-25/32/92/363/367 | 2859 | 2866 | 1A,M8 | HSA-MIR-25脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
hsa-miR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
hsa-miR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
HSA-MIR-92BSZ | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
mir-26 | 2619 | 2626 | 1A,M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc | ||||
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc | ||||
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-29 | 1741年 | 1747年 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu | ||||
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
mir-30-3p | 2475 | 2481 | M8 | hsa-miR-30a-3p | cuuucagucggauguugcagc |
hsa-miR-30e-3p | cuuucagucggauguauacagc | ||||
hsa-miR-30a-3p | cuuucagucggauguugcagc | ||||
hsa-miR-30e-3p | cuuucagucggauguauacagc | ||||
miR-320 | 2804 | 2811 | 1A,M8 | HSA-MIR-320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
miR-323 | 2924 | 2930 | M8 | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
miR-328 | 2216 | 2222 | M8 | HSA-MIR-328脑 | CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGU |
mir-365 | 2378 | 2384 | 1a | hsa-miR-365 | uaaugccccuaaaaaauccuuau |
miR-369-3p | 2389 | 2395 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu | ||||
mir-374 | 2389 | 2395 | M8 | hsa-miR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
hsa-miR-374 | uuauaauacaAccugauaagug | ||||
mir-410 | 2391 | 2397 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu | ||||
mir-485-5p | 3096 | 3102 | M8 | HSA-MIR-485-5p | aggcuggccgugaugauuc |
mir-486 | 3186 | 3193 | 1A,M8 | HSA-MIR-486 | UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG |
HSA-MIR-486 | UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG | ||||
mir-494 | 2313 | 2320 | 1A,M8 | HSA-MIR-494脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
HSA-MIR-494脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU | ||||
mir-495 | 3232 | 3239 | 1A,M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||
mir-542-3p | 353 | 359 | M8 | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |
miR-543 | 2311 | 2317 | M8 | HSA-MIR-543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |