基因页：SLC4A10
概括？
| 基因 | 57282 |
| 象征 | SLC4A10 |
| 同义词 | nbcn2 | ncbe |
| 描述 | Solute Carrier家族4成员10 |
| 参考 | MIM：605556|HGNC：HGNC：13811|ENSEMBL：ENSG00000144290|Vega：Otthumg00000153938 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q24.2 |
| Pascal P值 | 0.036 |
| 胎儿β | -1.319 |
| 支持 | 离子平衡 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2909457 | CHR2 | 162845855 | Ag | 4.375E-8 | 基因间 | SLC4A10，DPP4 | dist = 4069; dist = 2900 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005452 | 无机阴离子交换器活动 | IEA | - | |
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 去：0008509 | 阴离子跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
| GO：0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
| GO：0015297 | 抗植物活性 | IEA | - | |
| GO：0031402 | 钠离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006821 | 氯化物运输 | nas | 10993873 | |
| 去：0006820 | 阴离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006814 | 钠离子运输 | IEA | - | |
| GO：0015701 | 碳酸氢盐运输 | nas | 10993873 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | 10993873 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Teramoto OPN目标群集7 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-125/351 | 57 | 64 | 1A，M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
| mir-330 | 155 | 162 | 1A，M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-339 | 73 | 80 | 1A，M8 | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |
| mir-376 | 87 | 93 | M8 | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
| HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||