基因页:PTGD
概括?
基因 | 5730 |
象征 | PTGD |
同义词 | l-pgds | lpgds | pds | pgd2 | pgds | pgds2 |
描述 | 前列腺素D2合酶 |
参考 | MIM:176803|HGNC:HGNC:9592|ENSEMBL:ENSG00000107317|HPRD:08904|Vega:Otthumg00000020957 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q34.2-Q34.3 |
Pascal P值 | 0.612 |
Sherlock P值 | 0.597 |
胎儿β | -2.132 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11706314 | CHR3 | 45309716 | PTGD | 5730 | 0.14 | 反式 | ||
RS11706394 | CHR3 | 45309907 | PTGD | 5730 | 0.16 | 反式 | ||
RS2976809 | CHR3 | 125451738 | PTGD | 5730 | 0.15 | 反式 | ||
RS16894149 | CHR5 | 61013724 | PTGD | 5730 | 0.03 | 反式 | ||
RS6449550 | CHR5 | 61034312 | PTGD | 5730 | 0.06 | 反式 | ||
RS4489051 | CHR5 | 147954484 | PTGD | 5730 | 0.18 | 反式 | ||
RS6455226 | CHR6 | 67930295 | PTGD | 5730 | 0.15 | 反式 | ||
RS2199402 | CHR8 | 9201002 | PTGD | 5730 | 0 | 反式 | ||
RS2169384 | CHR8 | 9216985 | PTGD | 5730 | 0.05 | 反式 | ||
RS1381350 | CHR8 | 9217194 | PTGD | 5730 | 0.09 | 反式 | ||
RS7841407 | CHR8 | 9243427 | PTGD | 5730 | 5.531E-5 | 反式 | ||
RS11112163 | CHR12 | 105072508 | PTGD | 5730 | 0.13 | 反式 | ||
RS17720221 | CHR13 | 75182377 | PTGD | 5730 | 0.08 | 反式 | ||
RS10149864 | CHR14 | 86719683 | PTGD | 5730 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTGDS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0005501 | 类维生素类似的结合 | ISS | - | |
去:0004667 | 前列腺素-D合酶活性 | ISS | - | |
GO:0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | ISS | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001516 | 前列腺素生物合成过程 | ISS | - | |
去:0006810 | 运输 | ISS | - | |
去:0006633 | 脂肪酸生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
GO:0045187 | 调节昼夜节律睡眠/唤醒周期,睡眠 | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005791 | 粗面内质网 | 艾达 | 9065498 | |
去:0005794 | 高尔基体 | ISS | - | |
去:0005576 | 细胞外区域 | 艾达 | 7692978 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0031965 | 核膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujiwara Park2肝细胞增殖DN | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江是衰老下丘脑DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
兰普早期丰富学习环境 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
安倍的内耳 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江口大脑皮层DN | 54 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化DN | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Midbrain标记 | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McGowan RSP6靶向 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集12 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
winnepenninckx黑色素瘤转移DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 | 58 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Changolkar H2AFY目标DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |