概括
基因 5730
象征 PTGD
同义词 l-pgds | lpgds | pds | pgd2 | pgds | pgds2
描述 前列腺素D2合酶
参考 MIM:176803|HGNC:HGNC:9592|ENSEMBL:ENSG00000107317|HPRD:08904|Vega:Otthumg00000020957
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q34.2-Q34.3
Pascal P值 0.612
Sherlock P值 0.597
胎儿β -2.132
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11706314 CHR3 45309716 PTGD 5730 0.14 反式
RS11706394 CHR3 45309907 PTGD 5730 0.16 反式
RS2976809 CHR3 125451738 PTGD 5730 0.15 反式
RS16894149 CHR5 61013724 PTGD 5730 0.03 反式
RS6449550 CHR5 61034312 PTGD 5730 0.06 反式
RS4489051 CHR5 147954484 PTGD 5730 0.18 反式
RS6455226 CHR6 67930295 PTGD 5730 0.15 反式
RS2199402 CHR8 9201002 PTGD 5730 0 反式
RS2169384 CHR8 9216985 PTGD 5730 0.05 反式
RS1381350 CHR8 9217194 PTGD 5730 0.09 反式
RS7841407 CHR8 9243427 PTGD 5730 5.531E-5 反式
RS11112163 CHR12 105072508 PTGD 5730 0.13 反式
RS17720221 CHR13 75182377 PTGD 5730 0.08 反式
RS10149864 CHR14 86719683 PTGD 5730 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005488 捆绑 IEA -
去:0005501 类维生素类似的结合 ISS -
去:0004667 前列腺素-D合酶活性 ISS -
GO:0016853 异构酶活性 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001516 前列腺素生物合成过程 ISS -
去:0006810 运输 ISS -
去:0006633 脂肪酸生物合成过程 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 IEA -
GO:0045187 调节昼夜节律睡眠/唤醒周期,睡眠 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005791 粗面内质网 艾达 9065498
去:0005794 高尔基体 ISS -
去:0005576 细胞外区域 艾达 7692978
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0031965 核膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg蛛网膜酸代谢 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujiwara Park2肝细胞增殖DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江是衰老下丘脑DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰普早期丰富学习环境 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
安倍的内耳 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江口大脑皮层DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS脂肪细胞分化DN 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Midbrain标记 82 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McGowan RSP6靶向 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集12 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC LCP带有H3K4ME3 58 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染2小时 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Changolkar H2AFY目标DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因