基因页面:SENP7
总结吗?
GeneID | 57337年 |
象征 | SENP7 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | SUMO1 / sentrin特定肽酶7 |
参考 | MIM: 612846|HGNC: HGNC: 30402|运用:ENSG00000138468|HPRD: 07154|织女:OTTHUMG00000149927 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 q12 |
帕斯卡假定值 | 0.458 |
胎儿β | 2.084 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04359 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.04047 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg03445127 | 3 | 101232168 | SENP7 | 1.69 e-9 | -0.01 | 1.49 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SENP7_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008234 | cysteine-type肽酶的活动 | NAS | - - - - - - | |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006511 | ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016925 | 蛋白质sumoylation | 国际空间站 | 10652325 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 艾达 | 11256614 | |
去:0005634 | 核 | 国际空间站 | 10652325 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1 HSC融合起来 | 185年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NOUZOVA维甲酸和H4乙酰化作用 | 143年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 138 | 55 | 61年 | 1 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
mir - 144 | 460年 | 466年 | m8 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
mir - 153 | 272年 | 278年 | 1 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
mir - 217 | 449年 | 456年 | 1、m8 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
mir - 448 | 272年 | 278年 | 1 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
mir - 485 - 3 - p | 454年 | 460年 | 1 | hsa - mir - 485 - 3 - p | GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU |
mir - 543 | 296年 | 302年 | m8 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |