基因页：ptgfrn
概括？
| 基因 | 5738 |
| 象征 | ptgfrn |
| 同义词 | CD315 | CD9P-1 | EWI-F | FPRP | SMAP-6 |
| 描述 | 前列腺素F2受体抑制剂 |
| 参考 | MIM：601204|HGNC：HGNC：9601|ENSEMBL：ENSG00000134247|HPRD：03124|Vega：Otthumg0000000012028 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p13.1 |
| Pascal P值 | 0.171 |
| Sherlock P值 | 0.81 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14027204 | 1 | 117529478 | ptgfrn | 4.039E-4 | 0.267 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS5765916 | CHR22 | 45099825 | ptgfrn | 5738 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TP53BP1 | 0.93 | 0.95 |
| kif3c | 0.93 | 0.94 |
| polr3a | 0.93 | 0.94 |
| ACVR1B | 0.92 | 0.95 |
| PIP5K2B | 0.92 | 0.94 |
| SRGAP2P2 | 0.92 | 0.95 |
| jakmip2 | 0.92 | 0.94 |
| CAMSAP1 | 0.92 | 0.95 |
| AOF1 | 0.92 | 0.95 |
| CSNK2A1 | 0.92 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.77 | -0.88 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.87 |
| FXYD1 | -0.75 | -0.85 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.84 |
| HSD17B14 | -0.74 | -0.79 |
| higd1b | -0.73 | -0.85 |
| AF347015.33 | -0.73 | -0.82 |
| mt-cyb | -0.73 | -0.83 |
| TSC22D4 | -0.73 | -0.79 |
| S100B | -0.72 | -0.81 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11278880 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 冬季缺氧 | 92 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 唱歌转移基质 | 110 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA受伽马辐射损伤 | 81 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 恩格曼癌祖细胞dn | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Schwannoma DN | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Changolkar H2AFY目标 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 738 | 744 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-130/301 | 2586 | 2592 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-137 | 3042 | 3049 | 1A，M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag | ||||
| mir-144 | 3317 | 3323 | M8 | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
| mir-146 | 3132 | 3138 | M8 | HSA-MIR-146A | ugagaacugaauuccaugggug |
| HSA-MIR-146B脑 | ugagaacugaauuccauaggcu | ||||
| mir-153 | 3336 | 3342 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 200 | 206 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-18 | 717 | 724 | 1A，M8 | HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua |
| HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
| HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua | ||||
| HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
| mir-30-5p | 2720 | 2727 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag | ||||
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-33 | 3340 | 3346 | M8 | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
| HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
| mir-330 | 2962 | 2968 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-448 | 3336 | 3342 | 1a | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| mir-9 | 3011 | 3017 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |