基因页：CLK4
概括？
| 基因 | 57396 |
| 象征 | CLK4 |
| 同义词 | - |
| 描述 | CDC像激酶4 |
| 参考 | MIM：607969|HGNC：HGNC：13659|ENSEMBL：ENSG00000113240|HPRD：12140|Vega：Otthumg00000130893 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q35 |
| Pascal P值 | 0.745 |
| Sherlock P值 | 0.339 |
| 胎儿β | 1.819 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.0276 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08812692 | 5 | 178052235 | CLK4 | 7.47e-5 | 0.474 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
| CG23202349 | 5 | 178053533 | CLK4 | 1.98E-9 | -0.01 | 1.63E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | CLK4 | 57396 | 8.49e-4 | 反式 | ||
| SNP_A-1919794 | 0 | CLK4 | 57396 | 0.11 | 反式 | |||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CLK4 | 57396 | 4.696E-9 | 反式 | ||
| RS6729020 | CHR2 | 189064719 | CLK4 | 57396 | 0.1 | 反式 | ||
| RS1368303 | CHR5 | 147672388 | CLK4 | 57396 | 4.595E-4 | 反式 | ||
| RS10259703 | CHR7 | 14090856 | CLK4 | 57396 | 0.02 | 反式 | ||
| RS6989594 | CHR8 | 126303866 | CLK4 | 57396 | 0.11 | 反式 | ||
| RS9409946 | Chr9 | 138293640 | CLK4 | 57396 | 0.16 | 反式 | ||
| RS17104720 | CHR14 | 77127308 | CLK4 | 57396 | 0 | 反式 | ||
| RS6574467 | CHR14 | 79179744 | CLK4 | 57396 | 0.01 | 反式 | ||
| RS10146003 | CHR14 | 79191170 | CLK4 | 57396 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CLK4 | 57396 | 1.7E-8 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004713 | 蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML静止与正常分裂 | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Naderi乳腺癌预后DN | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bystroem与IL5 DN相关 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 公园HSC标记 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和替代剪接DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ehlers neuploidy up | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-186 | 363 | 370 | 1A，M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |