基因页:ptgis
概括?
基因 | 5740 |
象征 | ptgis |
同义词 | CYP8 | CYP8A1 | PGIS | PTGI |
描述 | 前列腺素I2(Prostacyclin)合酶 |
参考 | MIM:601699|HGNC:HGNC:9603|ENSEMBL:ENSG00000124212|HPRD:09046|Vega:Otthumg00000033077 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.13 |
Pascal P值 | 9.064e-8 |
胎儿β | 1.635 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Ambalavanan_2016 | 整个外显子组测序 | 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7267348 | CHR20 | 48131036 | TC | 1.182E-7 | 内含子 | ptgis |
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ptgis | CHR20 | 48140626 | C | t | NM_000961 | p。(arg275gln) | 非单词snv | 1 | 儿童期精神分裂症 | DNM:Ambalavanan_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTGIS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块DN | 43 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahadevan伊马替尼抵抗DN | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Theodorou乳腺肿瘤发生 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen LVAD支持失败的心脏DN | 42 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
敏锐的回应罗格列酮DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇12的时间反应12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向DN | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |