基因页面:NMRAL1
总结吗?
| GeneID | 57407年 |
| 象征 | NMRAL1 |
| 同义词 | HSCARG | SDR48A1 |
| 描述 | 包含1 NmrA-like家庭领域 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 24987|运用:ENSG00000153406|HPRD: 13678|织女:OTTHUMG00000129468 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 16 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 1.18 e-6 |
| 夏洛克假定值 | 0.485 |
| 胎儿β | -0.531 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg14951292 | 16 | 4525986 | HMOX2; NMRAL1 | 8.39 e-5 | 0.484 | 0.026 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4786500 | chr16 | 4525264 | NMRAL1 | 57407年 | 0.16 | 独联体 | ||
| rs9729667 | chr1 | 78349213 | NMRAL1 | 57407年 | 0.12 | 反式 | ||
| snp_a - 1856993 | 0 | NMRAL1 | 57407年 | 0.18 | 反式 | |||
| rs8046295 | 16 | 4528634 | NMRAL1 | ENSG00000153406.9 | 1.74544 e-6 | 0.03 | 17130年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8043603 | 16 | 4573332 | NMRAL1 | ENSG00000153406.9 | 9.34004 e - | 0.03 | -27568年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN ROZANOV MMP14目标 | 35 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 詹女士多发性骨髓瘤DN | 46 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |