基因页：NDRG2
概括？
| 基因 | 57447 |
| 象征 | NDRG2 |
| 同义词 | Syld |
| 描述 | NDRG家庭成员2 |
| 参考 | MIM：605272|HGNC：HGNC：14460|Ensembl：ENSG00000165795|HPRD：17630|Vega：Otthumg0000000029619 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.094 |
| Sherlock P值 | 0.536 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 支持 | 细胞内信号转导 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.047 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08939481 | 14 | 21494269 | NDRG2 | 9.59e-8 | 0.583 | 0.003 | DMG：Wockner_2014 |
| CG07102072 | 14 | 21538084 | NDRG2 | 1.03E-8 | -0.008 | 4.45e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突（GO期限：5） | - |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005813 | 中心体 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005829 | 细胞质 | nas | 11936845 | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chebotaev gr目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林格伦膀胱癌高复发 | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Teramoto OPN目标群集6 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约翰逊脑癌早期与晚期DN | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合top20 up的torchia目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO上皮分化模块 | 69 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-28 | 178 | 184 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
| mir-382 | 786 | 792 | M8 | HSA-MIR-382脑 | Gaaguuucgugguggauucg |