基因页:pth1r
Summary?
基因ID | 5745 |
象征 | pth1r |
同义词 | PFE | PTHR | PTHR1 |
描述 | 甲状旁腺激素1受体 |
参考 | MIM:168468|HGNC:HGNC:9608|ENSEMBL:ENSG00000160801|HPRD:01347|Vega:Otthumg00000133515 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P22-P21.1 |
Pascal P值 | 0.714 |
Sherlock P值 | 0.085 |
胎儿β | -1.311 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.009 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01178538 | 3 | 46932994 | pth1r | 1.46E-4 | 0.261 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG11733272 | 3 | 46940439 | pth1r | 5.921E-4 | -0.45 | 0.05 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11582961 | CHR1 | 184023058 | pth1r | 5745 | 0.15 | 反式 | ||
RS17801458 | CHR2 | 142468471 | pth1r | 5745 | 0.16 | 反式 | ||
RS2422581 | CHR20 | 1495234 | pth1r | 5745 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTH1R_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HCK | 0.81 | 0.72 |
ITGB2 | 0.79 | 0.73 |
CD14 | 0.79 | 0.70 |
CSF3R | 0.78 | 0.70 |
Lilrb4 | 0.77 | 0.74 |
SPI1 | 0.77 | 0.76 |
CD68 | 0.76 | 0.62 |
DOCK2 | 0.75 | 0.59 |
SIGLEC10 | 0.75 | 0.61 |
WDFY4 | 0.74 | 0.68 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Neurod6 | -0.26 | -0.18 |
Scube1 | -0.26 | -0.16 |
GPR22 | -0.26 | -0.21 |
FAT4 | -0.26 | -0.11 |
SATB2 | -0.25 | -0.12 |
SRGAP1 | -0.25 | -0.12 |
mycn | -0.25 | -0.14 |
Bach2 | -0.25 | -0.10 |
Neurod2 | -0.25 | -0.13 |
Dact1 | -0.25 | -0.12 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0004930 | G蛋白偶联受体活性 | IEA | - | |
去:0004991 | parathyroid hormone receptor activity | IEA | - | |
去:0004991 | parathyroid hormone receptor activity | 塔斯 | 9927325 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001501 | 骨骼系统开发 | 塔斯 | 9745456 | |
去:0007187 | G蛋白信号传导,与环状核苷酸第二信使耦合 | 塔斯 | 9927325 | |
去:0007186 | g蛋白耦合信号pathw受体蛋白质ay | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10709993 | |
去:0005737 | cytoplasm | 塔斯 | 10709993 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9745456 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-133 | 46 | 52 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua |