Summary
基因ID 5745
象征 pth1r
同义词 PFE | PTHR | PTHR1
描述 甲状旁腺激素1受体
参考 MIM:168468|HGNC:HGNC:9608|ENSEMBL:ENSG00000160801|HPRD:01347|Vega:Otthumg00000133515
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P22-P21.1
Pascal P值 0.714
Sherlock P值 0.085
胎儿β -1.311
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.009

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01178538 3 46932994 pth1r 1.46E-4 0.261 0.031 DMG:Wockner_2014
CG11733272 3 46940439 pth1r 5.921E-4 -0.45 0.05 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11582961 CHR1 184023058 pth1r 5745 0.15 反式
RS17801458 CHR2 142468471 pth1r 5745 0.16 反式
RS2422581 CHR20 1495234 pth1r 5745 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HCK 0.81 0.72
ITGB2 0.79 0.73
CD14 0.79 0.70
CSF3R 0.78 0.70
Lilrb4 0.77 0.74
SPI1 0.77 0.76
CD68 0.76 0.62
DOCK2 0.75 0.59
SIGLEC10 0.75 0.61
WDFY4 0.74 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Neurod6 -0.26 -0.18
Scube1 -0.26 -0.16
GPR22 -0.26 -0.21
FAT4 -0.26 -0.11
SATB2 -0.25 -0.12
SRGAP1 -0.25 -0.12
mycn -0.25 -0.14
Bach2 -0.25 -0.10
Neurod2 -0.25 -0.13
Dact1 -0.25 -0.12

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004930 G蛋白偶联受体活性 IEA -
去:0004991 parathyroid hormone receptor activity IEA -
去:0004991 parathyroid hormone receptor activity 塔斯 9927325
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001501 骨骼系统开发 塔斯 9745456
去:0007187 G蛋白信号传导,与环状核苷酸第二信使耦合 塔斯 9927325
去:0007186 g蛋白耦合信号pathw受体蛋白质ay IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 10709993
去:0005737 cytoplasm 塔斯 10709993
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9745456

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GPCR的反应组信号传导 920 449 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome B类2 Secralin家族受体 88 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome G alpha的信号事件 121 82 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR配体结合 408 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿斯顿主要抑郁症 49 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab心脏中心与心室 249 170 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee衰老的肌肉DN 46 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
durchdewald皮肤致癌 88 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN 540 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G23 DN 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA DN 267 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delacroix Rar Bound ES 462 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-133 46 52 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua