基因页面:DSCAML1
总结吗?
| GeneID | 57453年 |
| 象征 | DSCAML1 |
| 同义词 | DSCAM2 |
| 描述 | 唐氏综合症等细胞粘附分子1 |
| 参考 | MIM: 611782|HGNC: HGNC: 14656|运用:ENSG00000177103|HPRD: 10921|织女:OTTHUMG00000167071 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q23处 |
| 帕斯卡假定值 | 0.024 |
| 夏洛克假定值 | 0.244 |
| 胎儿β | 0.32 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg27074292 | 11 | 117417377 | DSCAML1 | 1.081的军医 | -0.335 | 0.028 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7202866 | chr16 | 47735029 | DSCAML1 | 57453年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs5979884 | chrX | 13481807 | DSCAML1 | 57453年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042803 | 蛋白质homodimerization活动 | 艾达 | 11453658 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007420 | 大脑发育 | 艾达 | 大脑(术语层面:7) | 12051741 |
| 去:0007409 | axonogenesis | NAS | 神经元,轴突神经突(术语层面:12) | 11453658 |
| 去:0001709 | 细胞命运的决心 | NAS | 12051741 | |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009953 | 背侧和腹侧形成模式 | NAS | 12051741 | |
| 去:0048704 | 胚胎骨骼系统形态发生 | 艾达 | 12051741 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 11453658 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME细胞细胞通讯 | 120年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME DSCAM交互 | 11 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标C DN | 19 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘肝癌 | 38 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT核心少突细胞分化 | 40 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-25/32/92/363/367 | 534年 | 541年 | 1、m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| mir - 376 | 509年 | 516年 | 1、m8 | hsa - mir - 376 a | AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU |
| hsa - mir - 376 b | AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU | ||||
| mir - 433 - 3 - p | 133年 | 140年 | 1、m8 | hsa - mir - 433大脑 | AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU |
| mir - 493 - 5 - p | 162年 | 168年 | 1 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
| mir - 494 | 548年 | 554年 | m8 | hsa - mir - 494大脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
| mir - 539 | 315年 | 321年 | m8 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |