基因页:REXO1
概括?
基因 | 57455 |
象征 | REXO1 |
同义词 | eloabp1 | eloa-bp1 | rex1 | tceb3bp1 |
描述 | REX1,RNA外切酶1同源物 |
参考 | MIM:609614|HGNC:HGNC:24616|Ensembl:ENSG00000079313|HPRD:15478|Vega:Otthumg00000179991 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Pascal P值 | 7.733E-4 |
Sherlock P值 | 0.126 |
主持人 | 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11673096 | 19 | 1624765 | REXO1 | ENSG0000000079313.7 | 8.27063E-7 | 0.03 | 223687 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11670039 | 19 | 1624766 | REXO1 | ENSG0000000079313.7 | 1.06457E-6 | 0.03 | 223686 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/REXO1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高与低DN | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康拉德干细胞 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |