基因页面:SLC12A5
总结吗?
| GeneID | 57468年 |
| 象征 | SLC12A5 |
| 同义词 | EIEE34 | EIG14 | KCC2 | hKCC2 |
| 描述 | 溶质载体家庭12成员5 |
| 参考 | MIM: 606726|HGNC: HGNC: 13818|运用:ENSG00000124140|HPRD: 09469|织女:OTTHUMG00000032638 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20 q13.12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.049 |
| 夏洛克假定值 | 0.924 |
| 胎儿β | -3.241 |
| eGene | 元 |
| 支持 | 离子平衡 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_mGluR5 G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC132186.2 | 0.72 | 0.71 |
| SOSTDC1 | 0.70 | 0.57 |
| MYO16 | 0.70 | 0.50 |
| TMEM102 | 0.68 | 0.52 |
| NPNT | 0.67 | 0.55 |
| RTDR1 | 0.67 | 0.56 |
| TMEM145 | 0.67 | 0.61 |
| AC079061.1 | 0.67 | 0.59 |
| GDF10 | 0.66 | 0.70 |
| RASGEF1C | 0.65 | 0.50 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.37 | -0.22 |
| AF347015.31 | -0.37 | -0.23 |
| MT-CO2 | -0.37 | -0.22 |
| AF347015.8 | -0.36 | -0.23 |
| MT-CYB | -0.36 | -0.22 |
| AF347015.33 | -0.35 | -0.20 |
| AF347015.2 | -0.35 | -0.24 |
| AF347015.15 | -0.34 | -0.21 |
| AF347015.21 | -0.33 | -0.21 |
| AIF1L | -0.33 | -0.26 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SLC介导的跨膜运输 | 241年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME运输无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽 | 94年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |