基因页面:CNOT6

总结吗?
GeneID 57472年
象征 CNOT6
同义词 CCR4 | Ccr4a
描述 CCR4-NOT转录复合体亚基6
参考 MIM: 608951|HGNC: HGNC: 14099|运用:ENSG00000113300|HPRD: 12341|织女:OTTHUMG00000130935
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q35.3
帕斯卡假定值 0.224
夏洛克假定值 0.182
胎儿β 2.304
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.0276

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg09544279 5 179921349 CNOT6 3.793的军医 -0.193 0.043 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16829545 chr2 151977407 CNOT6 57472年 6.923 e - 反式
rs7584986 chr2 184111432 CNOT6 57472年 0.02 反式
rs3106445 chr3 165326464 CNOT6 57472年 0.14 反式
rs1199915 0 CNOT6 57472年 0.09 反式
rs520325 chr3 165361016 CNOT6 57472年 0.05 反式
rs7787830 chr7 98797019 CNOT6 57472年 0.07 反式
rs3118341 chr9 25185518 CNOT6 57472年 0.16 反式
rs2393316 chr10 59333070 CNOT6 57472年 0.1 反式
rs16955618 chr15 29937543 CNOT6 57472年 7.932 e-8 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SACM1L 0.87 0.84
NDUFS1 0.86 0.82
SENP2 0.85 0.82
SLC25A40 0.85 0.83
C2orf30 0.85 0.81
化学加工 0.84 0.84
FAM179B 0.84 0.81
FAR1 0.84 0.83
DDHD2 0.84 0.80
DPP8 0.83 0.81
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
IL32 -0.49 -0.43
CLEC3B -0.47 -0.54
AF347015.21 -0.45 -0.29
C16orf74 -0.42 -0.39
AF347015.18 -0.42 -0.29
C1orf61 -0.41 -0.46
FAM159B -0.40 -0.39
CSAG1 -0.40 -0.34
CLDN5 -0.39 -0.37
AC098691.2 -0.39 -0.31

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0003723 核糖核酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004527 核酸外切酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG RNA降解 59 37 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME DEADENYLATION MRNA的 22 14 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信使rna代谢 284年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME DEADENYLATION依赖MRNA衰变 48 29日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA代谢 330年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
UDAYAKUMAR MED1目标了 135年 82年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素DN 770年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1目标了 566年 371年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受E2F4如果 728年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
张乳腺癌的祖细胞 425年 253年 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝母细胞癌类了 605年 377年 所有SZGR 2.0基因通路
肿瘤抑制SMAD1和穿SMAD5 DN 157年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
IKEDA MIR30目标了 116年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
FORTSCHEGGER PHF8目标了 279年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 784年 464年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-10 3699年 3705年 m8 hsa-miR-10a UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG
hsa-miR-10b UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU
mir - 128 933年 939年 m8 hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
miR-130/301 616年 622年 m8 hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
miR-148/152 3482年 3488年 m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 3043年 3049年 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir - 182 3991年 3998年 1、m8 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
miR-19 615年 621年 m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir - 193 356年 363年 1、m8 hsa - mir - 193 a AACUGGCCUACAAAGUCCCAG
hsa - mir - 193 b AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCUUU
mir - 199 3484年 3490年 1 hsa - mir - 199 a CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC
hsa - mir - 199 b CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC
mir - 200 bc / 429 3363年 3369年 m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
miR-21 770年 776年 m8 hsa-miR-21大脑 UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa - mir - 590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
miR-24 176年 182年 m8 hsa-miR-24深圳 UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
miR-29 155年 161年 1 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-30-5p 3499年 3505年 m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 320 2236年 2242年 1 hsa - mir - 320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
mir - 329 213年 219年 m8 hsa - mir - 329大脑 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
mir - 339 203年 210年 1、m8 hsa - mir - 339 UCCCUGUCCUCCAGGAGCUCA
miR-34/449 965年 971年 m8 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC
mir - 342 1032年 1038年 1 hsa - mir - 342大脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
miR-34b 966年 972年 m8 hsa-miR-34b UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG
mir - 377 1961年 1967年 1 hsa - mir - 377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir - 381 453年 459年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 382 727年 733年 1 hsa - mir - 382大脑 GAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCG
mir - 410 3693年 3699年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 433 - 3 - p 2017年 2023年 m8 hsa - mir - 433大脑 AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU
mir - 485 - 3 - p 143年 149年 1 hsa - mir - 485 - 3 - p GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU
mir - 493 - 5 - p 827年 833年 m8 hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
mir - 494 3762年 3768年 1 hsa - mir - 494大脑 UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU
hsa - mir - 494大脑 UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU
mir - 495 2164年 2170年 1 hsa - mir - 495大脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir - 504 3700年 3706年 m8 hsa - mir - 504 AGACCCUGGUCUGCACUCUAU
miR-7 382年 388年 1 hsa-miR-7深圳 UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 2145年 2152年 1、m8 hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU
hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU
mir - 96 3992年 3998年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC