基因页：plekhg1

概括？
基因 57480
象征 plekhg1
同义词 Arhgef41
描述 Pleckstrin同源性和含有G1的Rhogef域
参考 HGNC：HGNC：20884|Ensembl：ENSG00000120278|Vega：Otthumg0000000015824
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.1
Pascal P值 0.008
DMG 2（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 3
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG08419879 6 151152916 plekhg1 1.992E-4 0.386 0.035 DMG：Wockner_2014
CG03598499 6 150921355 plekhg1 3.899E-4 -0.277 0.043 DMG：Wockner_2014
CG07146578 6 150921569 plekhg1 8.78e-9 -0.014 4.04e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005089 Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去：0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0035023 调节Rho蛋白信号转导的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kim Myc放大目标DN 97 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-218 137 143 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu