基因页面:AARS2
总结吗?
GeneID | 57505年 |
象征 | AARS2 |
同义词 | AARSL | COXPD8 | LKENP | MT-ALARS | MTALARS |
描述 | alanyl-tRNA合成酶2,线粒体 |
参考 | MIM: 612035|HGNC: HGNC: 21022|运用:ENSG00000124608|HPRD: 12397|织女:OTTHUMG00000014766 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 p21.1 |
帕斯卡假定值 | 0.406 |
夏洛克假定值 | 5.53 e-5 |
胎儿β | 0.352 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16829545 | chr2 | 151977407 | AARS2 | 57505年 | 1.204的军医 | 反式 | ||
rs17124813 | chr10 | 110347464 | AARS2 | 57505年 | 0.13 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | AARS2 | 57505年 | 0 | 反式 | ||
rs6032295 | chr20 | 44178138 | AARS2 | 57505年 | 0.01 | 反式 | ||
rs463433 | chr21 | 28179781 | AARS2 | 57505年 | 0.07 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AARS2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004813 | alanine-tRNA连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016874 | 连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006419 | alanyl-tRNA氨酰化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006412 | 翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043039 | tRNA氨酰化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005739 | 线粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氨酰生物合成 | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME线粒体TRNA氨酰化 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME TRNA氨酰化 | 42 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GAUSSMANN MLL AF4融合目标 | 90年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |