Gene Page:MTUS1

概括?
GeneID 57509
Symbol MTUS1
Synonyms ATBP|ATIP|ICIS|MP44|MTSG1
描述 microtubule associated tumor suppressor 1
参考 MIM:609589|HGNC：HGNC：29789|Ensembl:ENSG00000129422|HPRD:11376|Vega:OTTHUMG00000163756
Gene type protein-coding
Map location 8p22
Pascal p-value 0.012
Sherlock P值 0.525
度p-value DEG：ZHAO_2015：P = 7.13E-04：Q = 0.0991
DMG 1（＃研究）
eGene Hippocampus

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DEG：Zhao_2015 RNA测序分析 Transcriptome sequencing and genome-wide association analyses reveal lysosomal function and actin cytoskeleton remodeling in schizophrenia and bipolar disorder.
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.031
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(All samples) Psr: 0.03086
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） Psr: 0.00057

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg16493813 8 17521952 MTUS1 2.48E-5 -0.424 0.017 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0045786 negative regulation of cell cycle IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005794 Golgi apparatus IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005739 mitochondrion IEA -
GO:0005886 plasma membrane IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T CELL PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 16D DN 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF DN 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霁转移STK11压抑 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG IMMORTALIZED BY HOXA9 AND MEIS1 UP 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS ADIPOCYTE DIFFERENTIATION UP 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 10HR DN 56 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK DN 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS UP 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CLIMENT BREAST CANCER COPY NUMBER DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAMIKUBO MYELOID MN1 NETWORK 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROESSLER LIVER CANCER METASTASIS DN 53 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-125/351 322 328 m8 HSA-MIR-125B脑 UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA
HSA-MIR-125A脑 UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir-135 553 560 1A,m8 hsa-miR-135a Uauggcuuuuuuuuccuauga
hsa-miR-135b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir-137 568 575 1A,m8 hsa-miR-137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir-139 752 758 1A hsa-miR-139脑 UCUACAGUGCACGUGUCU
miR-19 250 256 1A hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
MiR-200BC/429 1512年 1518年 m8 HSA-MIR-200B UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
miR-539 803 809 1A hsa-miR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 258 265 1A,m8 hsa-miR-93脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
HSA-MIR-302A UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
HSA-MIR-302B UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
HSA-MIR-302C UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
HSA-MIR-302D UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa-miR-372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa-miR-373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa-miR-520e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
HSA-MIR-520C AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
HSA-MIR-520D AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU