概括
基因 57511
象征 COG6
同义词 cdg2l | cod2 | shns
描述 寡聚高尔基络合物的成分6
参考 MIM:606977|HGNC:HGNC:18621|ENSEMBL:ENSG00000133103|HPRD:08445|Vega:Otthumg0000000016768
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q14.11
Pascal P值 0.063
Sherlock P值 0.523
胎儿β -0.548
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21142158 13 40229689 COG6 1.29e-8 -0.018 5.18e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RNF145 0.92 0.95
EIF4G2 0.92 0.95
mgat2 0.91 0.94
TDG 0.91 0.95
PCDHA3 0.90 0.94
PKIA 0.90 0.94
HSDL1 0.89 0.94
Zwilch 0.89 0.94
SQLE 0.89 0.94
PJA1 0.89 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.74 -0.80
AIFM3 -0.74 -0.79
AF347015.31 -0.74 -0.88
AF347015.27 -0.74 -0.87
AF347015.33 -0.73 -0.88
S100B -0.73 -0.84
MT-CO2 -0.73 -0.89
TSC22D4 -0.73 -0.81
FXYD1 -0.73 -0.88
hepn1 -0.72 -0.79

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto心脏质量QTL顺式DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng正常老化DN 30 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征DN 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因