基因页:COG6
概括?
基因 | 57511 |
象征 | COG6 |
同义词 | cdg2l | cod2 | shns |
描述 | 寡聚高尔基络合物的成分6 |
参考 | MIM:606977|HGNC:HGNC:18621|ENSEMBL:ENSG00000133103|HPRD:08445|Vega:Otthumg0000000016768 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q14.11 |
Pascal P值 | 0.063 |
Sherlock P值 | 0.523 |
胎儿β | -0.548 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21142158 | 13 | 40229689 | COG6 | 1.29e-8 | -0.018 | 5.18e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COG6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RNF145 | 0.92 | 0.95 |
EIF4G2 | 0.92 | 0.95 |
mgat2 | 0.91 | 0.94 |
TDG | 0.91 | 0.95 |
PCDHA3 | 0.90 | 0.94 |
PKIA | 0.90 | 0.94 |
HSDL1 | 0.89 | 0.94 |
Zwilch | 0.89 | 0.94 |
SQLE | 0.89 | 0.94 |
PJA1 | 0.89 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.74 | -0.80 |
AIFM3 | -0.74 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.88 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.88 |
S100B | -0.73 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.73 | -0.81 |
FXYD1 | -0.73 | -0.88 |
hepn1 | -0.72 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petretto心脏质量QTL顺式DN | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng正常老化DN | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征DN | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |