概括
基因 57521
象征 rptor
同义词 KOG1 | MIP1
描述 MTOR的调节蛋白,复合物1
参考 MIM:607130|HGNC:HGNC:30287|ENSEMBL:ENSG00000141564|HPRD:06184|Vega:Otthumg00000177622
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q25.3
Pascal P值 3.715E-6
Sherlock P值 0.071
胎儿β -0.376
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 5
DMG:Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 5
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13549638 17 78860076 rptor 6.7e-7 0.013 0.014 DMG:Montano_2016
CG27457201 17 78854232 rptor 7.92E-6 0.008 0.038 DMG:Montano_2016
CG16660971 17 78860029 rptor 5.97E-5 0.011 0.103 DMG:Montano_2016
CG22091236 17 78853966 rptor 1.52E-4 0.007 0.141 DMG:Montano_2016
CG22882460 17 78654648 rptor 1.43e-8 0.022 5.52E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17281577 CHR3 119051988 rptor 57521 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
EIF3B EIF3-ETA |EIF3-P110 |EIF3-P116 |EIF3S9 |MGC104664 |MGC131875 |PRT1 真核翻译起始因子3,亚基B 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
EIF3C EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 真核翻译起始因子3,亚基C 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16286006
EIF4EBP1 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12150926|12604610
|12747827|12912989
|15767663|16798736
|16824195|16837165
FKBP1A FKBP-12 |FKBP1 |FKBP12 |FKBP12C |PKC12 |PKCI2 |PPIASE FK506结合蛋白1A,12KDA 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15268862|15467718
frap1 FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 - HPRD,Biogrid 12150925
frap1 FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 mtor与猛禽互动。 绑定 15718470
GDI2P - GDP解离抑制剂2伪基因 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16354680
MAPKAP1 JC310 |MGC2745 |MIP1 |sin1 |sin1b |sin1g 有丝分裂原激活蛋白激酶相关蛋白1 亲和力捕获ms Biogrid 16962653
PDK1 - 丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12150926
PLD2 - 磷脂酶D2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 16837165
Rheb MGC111559 |Rheb2 富含大脑的Ras同源物 猛禽与Rheb互动。 绑定 15854902
Rheb MGC111559 |Rheb2 富含大脑的Ras同源物 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 15854902
Rictor DKFZP686B11164 |KIAA1999 |MGC39830 |Mavo3 雷帕霉素不敏感的伴侣 亲和力捕获ms Biogrid 16962653
RPS6KB1 PS6K |S6K |S6K1 |STK14A |P70(S6K)-Alpha |P70-S6K |P70-Alpha 核糖体蛋白S6激酶,70KDA,多肽1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12150926|12604610
|15809305|16837165


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LKB1途径 47 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MTORC1介导的信号传导 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corradetti MTOR途径调节器DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由EWS FLT1融合绑定的Siligan 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因