基因页:rptor
概括?
基因 | 57521 |
象征 | rptor |
同义词 | KOG1 | MIP1 |
描述 | MTOR的调节蛋白,复合物1 |
参考 | MIM:607130|HGNC:HGNC:30287|ENSEMBL:ENSG00000141564|HPRD:06184|Vega:Otthumg00000177622 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q25.3 |
Pascal P值 | 3.715E-6 |
Sherlock P值 | 0.071 |
胎儿β | -0.376 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 5 |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 5 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13549638 | 17 | 78860076 | rptor | 6.7e-7 | 0.013 | 0.014 | DMG:Montano_2016 |
CG27457201 | 17 | 78854232 | rptor | 7.92E-6 | 0.008 | 0.038 | DMG:Montano_2016 |
CG16660971 | 17 | 78860029 | rptor | 5.97E-5 | 0.011 | 0.103 | DMG:Montano_2016 |
CG22091236 | 17 | 78853966 | rptor | 1.52E-4 | 0.007 | 0.141 | DMG:Montano_2016 |
CG22882460 | 17 | 78654648 | rptor | 1.43e-8 | 0.022 | 5.52E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17281577 | CHR3 | 119051988 | rptor | 57521 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPTOR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
EIF3B | EIF3-ETA |EIF3-P110 |EIF3-P116 |EIF3S9 |MGC104664 |MGC131875 |PRT1 | 真核翻译起始因子3,亚基B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
EIF3C | EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 | 真核翻译起始因子3,亚基C | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16286006 |
EIF4EBP1 | 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i | 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12150926|12604610 |12747827|12912989 |15767663|16798736 |16824195|16837165 |
FKBP1A | FKBP-12 |FKBP1 |FKBP12 |FKBP12C |PKC12 |PKCI2 |PPIASE | FK506结合蛋白1A,12KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15268862|15467718 |
frap1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 12150925 |
frap1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | mtor与猛禽互动。 | 绑定 | 15718470 |
GDI2P | - | GDP解离抑制剂2伪基因 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16354680 |
MAPKAP1 | JC310 |MGC2745 |MIP1 |sin1 |sin1b |sin1g | 有丝分裂原激活蛋白激酶相关蛋白1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16962653 |
PDK1 | - | 丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12150926 |
PLD2 | - | 磷脂酶D2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 16837165 |
Rheb | MGC111559 |Rheb2 | 富含大脑的Ras同源物 | 猛禽与Rheb互动。 | 绑定 | 15854902 |
Rheb | MGC111559 |Rheb2 | 富含大脑的Ras同源物 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15854902 |
Rictor | DKFZP686B11164 |KIAA1999 |MGC39830 |Mavo3 | 雷帕霉素不敏感的伴侣 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16962653 |
RPS6KB1 | PS6K |S6K |S6K1 |STK14A |P70(S6K)-Alpha |P70-S6K |P70-Alpha | 核糖体蛋白S6激酶,70KDA,多肽1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12150926|12604610 |15809305|16837165 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LKB1途径 | 47 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MTORC1介导的信号传导 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corradetti MTOR途径调节器DN | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由EWS FLT1融合绑定的Siligan | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |