概括
基因 57526
象征 PCDH19
同义词 EFMR | EIEE9
描述 原钙粘蛋白19
参考 MIM:300460|HGNC:HGNC:14270|ENSEMBL:ENSG00000165194|HPRD:11843|Vega:Otthumg00000022000
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ22.1
Sherlock P值 0.87
胎儿β -0.28
支持 潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ADNP 0.96 0.93
ZNF445 0.96 0.92
tug1 0.95 0.94
USP24 0.95 0.95
HP1BP3 0.95 0.93
TBC1D14 0.95 0.94
asxl1 0.95 0.92
clasp1 0.95 0.93
TCEB3 0.95 0.92
C6orf174 0.95 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.74 -0.74
HLA-F -0.72 -0.72
AF347015.27 -0.72 -0.83
AF347015.31 -0.72 -0.84
MT-CO2 -0.71 -0.85
S100B -0.71 -0.77
AIFM3 -0.70 -0.70
FXYD1 -0.70 -0.81
CA4 -0.70 -0.73
ifi27 -0.70 -0.82

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
田中甲基化食管癌中的甲基化 103 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 DN 39 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因