基因页:PCDH19
概括?
基因 | 57526 |
象征 | PCDH19 |
同义词 | EFMR | EIEE9 |
描述 | 原钙粘蛋白19 |
参考 | MIM:300460|HGNC:HGNC:14270|ENSEMBL:ENSG00000165194|HPRD:11843|Vega:Otthumg00000022000 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ22.1 |
Sherlock P值 | 0.87 |
胎儿β | -0.28 |
支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PCDH19_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ADNP | 0.96 | 0.93 |
ZNF445 | 0.96 | 0.92 |
tug1 | 0.95 | 0.94 |
USP24 | 0.95 | 0.95 |
HP1BP3 | 0.95 | 0.93 |
TBC1D14 | 0.95 | 0.94 |
asxl1 | 0.95 | 0.92 |
clasp1 | 0.95 | 0.93 |
TCEB3 | 0.95 | 0.92 |
C6orf174 | 0.95 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.74 | -0.74 |
HLA-F | -0.72 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.83 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.85 |
S100B | -0.71 | -0.77 |
AIFM3 | -0.70 | -0.70 |
FXYD1 | -0.70 | -0.81 |
CA4 | -0.70 | -0.73 |
ifi27 | -0.70 | -0.82 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
田中甲基化食管癌中的甲基化 | 103 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标3 DN | 39 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |