基因页：Sorcs2
概括？
| 基因 | 57537 |
| 象征 | Sorcs2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 含有托硅蛋白相关的VPS10结构域含有受体2 |
| 参考 | MIM：606284|HGNC：HGNC：16698|ENSEMBL：ENSG00000184985|HPRD：12099|Vega：Otthumg00000159981 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4P16.1 |
| Pascal P值 | 0.1 |
| Sherlock P值 | 0.201 |
| DEG P值 | DEG：ZHAO_2015：P = 3.35E-04：Q = 0.0924 |
| 胎儿β | -0.445 |
| 主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13927832 | 4 | 7436861 | PSAPL1; SORCS2 | 5.718E-4 | 0.364 | 0.049 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6577553 | CHR1 | 9197460 | Sorcs2 | 57537 | 0.16 | 反式 | ||
| RS17010881 | CHR2 | 124878125 | Sorcs2 | 57537 | 0.1 | 反式 | ||
| RS9289452 | CHR3 | 133429642 | Sorcs2 | 57537 | 0.17 | 反式 | ||
| RS6879593 | CHR5 | 75253310 | Sorcs2 | 57537 | 0.14 | 反式 | ||
| RS16927065 | Chr10 | 26816050 | Sorcs2 | 57537 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF777 | 0.95 | 0.96 |
| ZNF574 | 0.94 | 0.96 |
| ZNF598 | 0.94 | 0.95 |
| CNOT3 | 0.94 | 0.95 |
| ATP13A1 | 0.94 | 0.95 |
| Men1 | 0.93 | 0.95 |
| ZNF446 | 0.93 | 0.93 |
| TUBGCP2 | 0.93 | 0.94 |
| TSC2 | 0.93 | 0.96 |
| DVL3 | 0.93 | 0.95 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.86 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.86 |
| AF347015.27 | -0.76 | -0.84 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.73 | -0.82 |
| C5orf53 | -0.73 | -0.74 |
| AF347015.8 | -0.72 | -0.84 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.89 |
| S100B | -0.70 | -0.77 |
| COPZ2 | -0.69 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008188 | 神经肽受体活性 | nas | 神经递质（GO期限：8） | 11499680 |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | nas | 11499680 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | nas | 神经递质（GO期限：8） | 11499680 |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | nas | 11499680 | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向E | 97 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 | 220 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 2567 | 2573 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 2567 | 2573 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-125/351 | 1148 | 1154 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||