基因页面:PTK7
总结吗?
GeneID | 5754年 |
象征 | PTK7 |
同义词 | CCK-4 | CCK4 |
描述 | 蛋白质酪氨酸激酶7(不活跃) |
参考 | MIM: 601890|HGNC: HGNC: 9618|运用:ENSG00000112655|HPRD: 03534|织女:OTTHUMG00000014721 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 p21.1-p12.2 |
帕斯卡假定值 | 2.851的军医 |
胎儿β | 0.787 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg09674015 | 6 | 43045187 | PTK7 | 8.05 e-8 | -0.021 | 1.88 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTK7_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RAB7A | 0.85 | 0.78 |
CTNNA2 | 0.85 | 0.83 |
EIF4G1 | 0.84 | 0.80 |
UXS1 | 0.83 | 0.78 |
GALNT11 | 0.81 | 0.73 |
HDLBP | 0.81 | 0.77 |
GNAO1 | 0.80 | 0.81 |
AC020663.1 | 0.79 | 0.76 |
PANK2 | 0.79 | 0.72 |
ABCF3 | 0.79 | 0.75 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.55 |
MT-CO2 | -0.61 | -0.53 |
AF347015.31 | -0.59 | -0.52 |
C1orf54 | -0.59 | -0.51 |
AF347015.8 | -0.59 | -0.50 |
HIGD1B | -0.58 | -0.50 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.50 |
AF347015.33 | -0.57 | -0.49 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.52 |
NOSTRIN | -0.56 | -0.43 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004714 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 | 助教 | 神经突(术语层面:8) | 8882711 |
去:0005021 | 血管内皮生长因子受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004713 | 蛋白质酪氨酸激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016301 | 激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0001843 | 神经管闭合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007155 | 细胞粘附 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006468 | 蛋白质磷酸化氨基酸 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 7478540 | |
去:0045198 | 建立上皮细胞顶端/底极性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 7478540 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DELYS甲状腺癌了 | 443年 | 294年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤324 | 150年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTORIATI MDM4目标神经上皮 | 176年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JAZAG TGFB1信号了 | 108年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JAZAG TGFB1信号通过SMAD4 DN | 66年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
英格拉姆嘘目标了 | 127年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
城堡内成神经管细胞瘤预后起 | 47 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
·林德沃它由叔DN | 80年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡DN | 287年 | 208年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李转移和可变剪接 | 74年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
华莱士前列腺癌种族DN | 88年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乳腺癌萧述三腔的DN | 564年 | 326年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
克罗默肿瘤发生了 | 63年 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
汉SATB1目标了 | 395年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
前列腺癌SETLUR TMPRSS2 ERG融合起来 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒30分钟 | 56 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒4人力资源 | 55 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACOSTA扩散独立MYC目标 | 84年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI TGFB1信号通过NFIC 1小时DN | 106年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GHANDHI直接辐照DN | 33 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |