概括
基因 57552
象征 NCEH1
同义词 aadacl1 | nceh
描述 中性胆固醇酯水解酶1
参考 MIM:613234|HGNC:HGNC:29260|Ensembl:ENSG00000144959|HPRD:07489|Vega:Otthumg00000156872
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q26.31
Pascal P值 0.032
Sherlock P值 0.379
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01232492 3 172429000 NCEH1 8.03e-10 -0.012 1.04E-6 DMG:JAFFE_2016
CG08037420 3 172428855 NCEH1 3.53e-9 -0.02 2.29e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS13023481 CHR2 213839772 NCEH1 57552 0.19 反式
RS10994209 Chr10 61877705 NCEH1 57552 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Prkcz 0.88 0.89
HMOX2 0.86 0.89
PPP1R3F 0.86 0.88
ENTPD6 0.86 0.88
Arhgef4 0.85 0.84
NRSN2 0.84 0.85
SH3BP1 0.84 0.86
MLF2 0.84 0.86
CGREF1 0.84 0.84
OTUB1 0.84 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.46 -0.20
AF347015.21 -0.44 -0.16
AC010300.1 -0.41 -0.30
MT-ATP8 -0.39 -0.15
AF347015.2 -0.38 -0.13
FAM159B -0.38 -0.46
AP002478.3 -0.38 -0.28
AF347015.8 -0.38 -0.16
AF347015.26 -0.37 -0.13
Rab13 -0.36 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应红色 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sana tnf发出信号 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuninger IGF1 vs PDGFB目标DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ivanovska mir106b目标 90 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向 61 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清敏感基因 90 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因