SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	5757
象征	PTMA
Synonyms	TMSA
Description	螺赛蛋白，α
Reference	MIM：188390\|HGNC：HGNC：9623\|ENSEMBL：ENSG00000187514\|HPRD：01778\|Vega：Otthumg00000153810
基因类型	蛋白质编码
Map location	2q37.1
Pascal p-value	0.202
Sherlock p-value	0.471
胎儿β	0.906
DMG	1(# studies)

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	全基因组协会研究	GWAS
DMG：JAFFE_2016	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。	1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

Probe	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
cg06155979	2	232575824	PTMA	5.25e-9	-0.014	2.93E-6	DMG：JAFFE_2016

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene	皮尔森的些小n	斯皮尔曼的相关性
NR2C2	0.92	0.93
KIAA0240	0.91	0.94
ABL2	0.91	0.93
HERC1	0.91	0.93
PCNX	0.91	0.94
JMY	0.91	0.94
NAV3	0.91	0.92
TANC2	0.91	0.94
MYO9A	0.90	0.94
C10orf18	0.90	0.93

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	皮尔森的些小n	斯皮尔曼的相关性
FXYD1	-0.69	-0.78
AF347015.31	-0.69	-0.78
HSD17B14	-0.68	-0.74
MT-CO2	-0.67	-0.78
serpinb6	-0.67	-0.70
HIGD1B	-0.67	-0.79
Metrn	-0.66	-0.80
ENHO	-0.66	-0.81
ifi27	-0.65	-0.75
TLCD1	-0.65	-0.76

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
CCNA2	CCN1 \| CCNA	cyclin A2	-	HPRD	11310559
CCNB1	CCNB	细胞周期蛋白B1	-	HPRD	11310559
CDC2	cdc28a \|CDK1 \|DKFZP686L20222 \|MGC111195	细胞分裂周期2，G1至S和G2至M	-	HPRD	11310559
CDK2	p33(CDK2)	细胞周期蛋白依赖性激酶2	-	HPRD	11310559
CDK4	CMM3 \|MGC14458 \|PSK-J3	细胞周期蛋白依赖性激酶4	-	HPRD	11310559
克雷布	CBP \| KAT3A \| RSTS	CREB结合蛋白	-	HPRD,BioGRID	11897665
ELAVL1	Elav1 \|hur \|hua \|梅尔	Elav（胚胎致死，异常视力，果蝇） - 类似1（Hu抗原R）	Elavl1（HUR）与PMTA（Prot-Alpha）mRNA相互作用。	绑定	15861128
EP300	kat3b \|P300	E1A binding protein p300	-	HPRD,BioGRID	11967287
ESR1	DKFZp686N23123 \| ER \| ESR \| ESRA \| Era \| NR3A1	estrogen receptor 1	重构的复合物	Biogrid	12943695
HDAC1	DKFZP686H12203 \|gon-10 \|HD1 \|RPD3 \|RPD3L1	histone deacetylase 1	-	HPRD,BioGRID	12634383
HDAC2	RPD3 \|yaf1	histone deacetylase 2	-	HPRD,BioGRID	12634383
HIST1H2BG	H2B.1A \|H2B/A \|H2BFA \|Hist1h2bf \|Hist1H2Bi \|DJ221C16.8	组蛋白簇1，H2BG	-	HPRD	8814229
Hist1h4a	H4/A \|H4FA	histone cluster 1, H4a	-	HPRD	11310559
Hist2H2BE	GL105 \| H2B \| H2B.1 \| H2B/q \| H2BFQ \| MGC119802 \| MGC119804 \| MGC129733 \| MGC129734	组蛋白集群2，H2BE	-	HPRD	11310559
Hist2H3C	H3 \|H3.2 \|H3/m \|H3F2 \|H3FM \|MGC9629	组蛋白簇2，H3C	-	HPRD	8814229
Hist2H4A	fo108 \|H4 \|H4/N \|H4F2 \|H4FN \|Hist2H4	histone cluster 2, H4a	-	HPRD	8814229
HIST3H3	H3.4 \| H3/g \| H3FT \| H3t \| MGC126886 \| MGC126888	组蛋白簇3，H3	-	HPRD	11310559
HNRNPA1	HNRPA1 \|MGC102835	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1	HNRPA1 (hnRNP A1) interacts with PTMA (ProT-alpha) mRNA.	绑定	15861128
HSPA1A	FLJ54303 \|FLJ54370 \|FLJ54392 \|FLJ54408 \|FLJ75127 \|HSP70-1 \|HSP70-1A \|HSP70I \|HSP72 \|HSPA1 \| HSPA1B	热休克70KDA蛋白1A	-	HPRD	11310559
KPNA2	IPOA1 \| QIP2 \| RCH1 \| SRP1alpha	核桃蛋白α2（抹布队1，importin alpha 1）	-	HPRD	11310559
KPNB1	IMB1 \| IPOB \| Impnb \| MGC2155 \| MGC2156 \| MGC2157 \| NTF97	karyopherin importin beta 1	-	HPRD	11310559
NCOR1	KIAA1047 \|MGC104216 \|n-cor \|trac1 \|HCIT529I10 \|hn-cor	核受体共抑制剂1	-	HPRD,BioGRID	12634383
NUP62	DKFZP547L134 \|FLJ20822 \|FLJ43869 \|IBSN \|MGC841 \|sndi \|p62	核孔蛋白62KDA	-	HPRD	11310559
PCNA	MGC8367	增殖细胞核抗原	-	HPRD	11310559
PHB2	bap \|BCAP37 \|BAP37 \|MGC117268 \|PNAS-141 \|Rea \|p22	禁止素2	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid	Biogrid	12943695
PHB2	bap \|BCAP37 \|BAP37 \|MGC117268 \|PNAS-141 \|Rea \|p22	禁止素2	PT-Alpha与Rea相互作用	绑定	10938099
RAN	ARA24 \|GSP1 \|TC4	RAN，RAS成员Ras Oncogene家族	-	HPRD	11310559
RCC1	CHC1 \|RCC1-i	染色体凝结的调节剂1	-	HPRD	11310559
sin3a	DKFZP434K2235 \|FLJ90319 \|KIAA0700	SIN3同源物A，转录调节剂（酵母）	重构的复合物	Biogrid	12634383
VIPR1	FLJ41949 \|HVR1 \|II \|PACAP-R-2 \|RDC1 \|vapc1 \|VIPR \|维格\|VPAC1 \|VPCAP1R	血管活性肠受体1	-	HPRD	8886855

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
PID MYC活动途径	79	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pramoonjago Sox4靶向DN	51	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌早期	430	232	All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向	135	82	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP	1278	748	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN	485	334	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Markey RB1急性LOF DN	228	137	All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗PML的目标是由Myc Up绑定	23	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Olsson E2F3靶向DN	49	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Appierto对Fenretinide DN的反应	51	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN	712	443	All SZGR 2.0 genes in this pathway
JAZAG TGFB1 SIGNALING VIA SMAD4 UP	108	66	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲	479	299	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络	1442	892	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN	1024	594	All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘乳腺癌	30	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移	539	324	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标	176	104	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发6小时DN	514	330	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath MYC带Ebox的目标	230	156	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SWEET KRAS TARGETS DN	66	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gnatenko血小板签名	48	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
西葫芦转移	43	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束	182	116	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者	555	346	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PARK HSC AND MULTIPOTENT PROGENITORS	50	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RHODES CANCER META SIGNATURE	64	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HU GENOTOXIN ACTION DIRECT VS INDIRECT 24HR	55	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病	1691	1088	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHANG PROLIFERATING VS QUIESCENT	51	41	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sesto对UV C7的反应	68	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应	911	527	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应	1011	592	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hillion HMGA1B目标	92	68	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由E2F4绑定的Marson未刺激	728	415	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻	174	96	All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌	871	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马洛尼对17AAG DN的回应	79	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib dn的Blum响应	342	220	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mueller Plurinet	299	189	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER SURVIVAL DN	175	103	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因	389	245	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP	442	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
JISON SICKLE CELL DISEASE DN	181	97	All SZGR 2.0 genes in this pathway
woo肝癌复发	105	75	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带有Inv 16易位	422	277	All SZGR 2.0 genes in this pathway
dang myc的目标	143	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束	1103	714	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马滕斯三维诺蛋白响应DN	841	431	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老	572	352	All SZGR 2.0 genes in this pathway
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN	918	550	All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹通过FN1信号传导翻译	35	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PECE MAMMARY STEM CELL UP	146	75	All SZGR 2.0 genes in this pathway
巨噬细胞的库马尔病原体负荷	275	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway

Gene Page:PTMA