概括
基因 57604
象征 KIAA1456
同义词 C8orf79 | TRM9L
描述 KIAA1456
参考 MIM:615666|HGNC:HGNC:26725|Ensembl:ENSG00000250305|HPRD:13862|Vega:Otthumg00000165477
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22
Pascal P值 2.06E-4
胎儿β 1.857
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14501253 8 12809014 KIAA1456 5.03e-8 -0.014 1.34E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AUP1 0.83 0.78
MRPL38 0.83 0.82
tusc4 0.82 0.79
yipf2 0.82 0.80
应付 0.82 0.81
C16orf84 0.81 0.76
WDR45 0.81 0.79
ndufs8 0.81 0.79
MRPL4 0.81 0.79
TMEM147 0.81 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-ATP8 -0.50 -0.52
AF347015.18 -0.48 -0.51
AF347015.8 -0.47 -0.45
AL139819.3 -0.45 -0.46
AF347015.2 -0.45 -0.43
AF347015.26 -0.44 -0.45
AF347015.15 -0.43 -0.42
mt-cyb -0.43 -0.44
AF347015.27 -0.42 -0.43
SEC62 -0.41 -0.50

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺开发中的目标 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因