基因页:KIAA1456
概括?
基因 | 57604 |
象征 | KIAA1456 |
同义词 | C8orf79 | TRM9L |
描述 | KIAA1456 |
参考 | MIM:615666|HGNC:HGNC:26725|Ensembl:ENSG00000250305|HPRD:13862|Vega:Otthumg00000165477 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p22 |
Pascal P值 | 2.06E-4 |
胎儿β | 1.857 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14501253 | 8 | 12809014 | KIAA1456 | 5.03e-8 | -0.014 | 1.34E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KIAA1456_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AUP1 | 0.83 | 0.78 |
MRPL38 | 0.83 | 0.82 |
tusc4 | 0.82 | 0.79 |
yipf2 | 0.82 | 0.80 |
应付 | 0.82 | 0.81 |
C16orf84 | 0.81 | 0.76 |
WDR45 | 0.81 | 0.79 |
ndufs8 | 0.81 | 0.79 |
MRPL4 | 0.81 | 0.79 |
TMEM147 | 0.81 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-ATP8 | -0.50 | -0.52 |
AF347015.18 | -0.48 | -0.51 |
AF347015.8 | -0.47 | -0.45 |
AL139819.3 | -0.45 | -0.46 |
AF347015.2 | -0.45 | -0.43 |
AF347015.26 | -0.44 | -0.45 |
AF347015.15 | -0.43 | -0.42 |
mt-cyb | -0.43 | -0.44 |
AF347015.27 | -0.42 | -0.43 |
SEC62 | -0.41 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer Sox9在前列腺开发中的目标 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |