基因页:RANBP10
概括?
基因 | 57610 |
象征 | RANBP10 |
同义词 | - |
描述 | 运行结合蛋白10 |
参考 | MIM:614031|HGNC:HGNC:29285|ENSEMBL:ENSG00000141084|HPRD:15207|Vega:Otthumg00000184044 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q22.1 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 0.947 |
胎儿β | 0.318 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01332403 | 16 | 67840704 | RANBP10 | 6.58e-8 | -0.01 | 1.62E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12405921 | CHR1 | 206695730 | RANBP10 | 57610 | 0.11 | 反式 | ||
RS17572651 | CHR1 | 218943612 | RANBP10 | 57610 | 0.09 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | RANBP10 | 57610 | 2.615e-11 | 反式 | ||
RS16841750 | CHR2 | 158288461 | RANBP10 | 57610 | 0.06 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | RANBP10 | 57610 | 1.594E-5 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | RANBP10 | 57610 | 2.37E-7 | 反式 | ||
RS336544 | CHR3 | 161060557 | RANBP10 | 57610 | 0.13 | 反式 | ||
RS2183142 | CHR4 | 159232695 | RANBP10 | 57610 | 0.15 | 反式 | ||
RS170776 | CHR4 | 173276735 | RANBP10 | 57610 | 0.13 | 反式 | ||
RS1396222 | CHR4 | 173279496 | RANBP10 | 57610 | 0.08 | 反式 | ||
RS335980 | CHR4 | 173329784 | RANBP10 | 57610 | 0.04 | 反式 | ||
RS335982 | CHR4 | 173330945 | RANBP10 | 57610 | 0.05 | 反式 | ||
RS337984 | CHR4 | 173411662 | RANBP10 | 57610 | 0.11 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | RANBP10 | 57610 | 3.516E-4 | 反式 | ||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | RANBP10 | 57610 | 0.02 | 反式 | ||
RS2393316 | Chr10 | 59333070 | RANBP10 | 57610 | 0.02 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | RANBP10 | 57610 | 5.532e-17 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | RANBP10 | 57610 | 2.176E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RANBP10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine乳头状甲状腺癌DN | 80 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹通过FN1信号传导翻译 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |