概括
基因 57610
象征 RANBP10
同义词 -
描述 运行结合蛋白10
参考 MIM:614031|HGNC:HGNC:29285|ENSEMBL:ENSG00000141084|HPRD:15207|Vega:Otthumg00000184044
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q22.1
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 0.947
胎儿β 0.318
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01332403 16 67840704 RANBP10 6.58e-8 -0.01 1.62E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12405921 CHR1 206695730 RANBP10 57610 0.11 反式
RS17572651 CHR1 218943612 RANBP10 57610 0.09 反式
RS16829545 CHR2 151977407 RANBP10 57610 2.615e-11 反式
RS16841750 CHR2 158288461 RANBP10 57610 0.06 反式
RS3845734 CHR2 171125572 RANBP10 57610 1.594E-5 反式
RS7584986 CHR2 184111432 RANBP10 57610 2.37E-7 反式
RS336544 CHR3 161060557 RANBP10 57610 0.13 反式
RS2183142 CHR4 159232695 RANBP10 57610 0.15 反式
RS170776 CHR4 173276735 RANBP10 57610 0.13 反式
RS1396222 CHR4 173279496 RANBP10 57610 0.08 反式
RS335980 CHR4 173329784 RANBP10 57610 0.04 反式
RS335982 CHR4 173330945 RANBP10 57610 0.05 反式
RS337984 CHR4 173411662 RANBP10 57610 0.11 反式
RS17762315 CHR5 76807576 RANBP10 57610 3.516E-4 反式
RS3118341 Chr9 25185518 RANBP10 57610 0.02 反式
RS2393316 Chr10 59333070 RANBP10 57610 0.02 反式
RS16955618 CHR15 29937543 RANBP10 57610 5.532e-17 反式
RS1041786 CHR21 22617710 RANBP10 57610 2.176E-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹通过FN1信号传导翻译 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因